MALDI微生物同定試験(Biotyper)

特 長

  • タンパク質マススペクトルパターンをデータベースと照合し同定
  • DNA塩基配列解析と比較し、迅速、低価格での報告が可能
  • 細菌、カビ(糸状菌)、酵母のすべてのカテゴリーの同定に対応
  • バイオセーフティレベル付きで報告
  • 当日12時(正午)までの到着検体(細菌・酵母の純粋培養物に限り)は、即日納品

概 要

MALDI Biotyper®(Bruker, DEU)は、細菌、カビ、酵母のタンパク質マススペクトルを取得し、データベースと照合し、検体の帰属・近縁種を同定します。MALDI-TOF MS 法は、迅速性やコストの低さから臨床・食品・製薬など様々な分野で普及が進んでいます。

細菌・酵母では、当社営業日の午前中に到着し、純化された平板培養物及び実施するコロニーやカテゴリーが明確であった場合には、ご送付検体より、直接、解析を行い即日報告が可能です。

カビでは、従来再現性が課題とされていましたが、ブルカージャパン株式会社から提供された前処理プロトコールにより、再現性が格段に改善されました。タンパク質抽出を効率よく行うために液体培地での前培養が必須となりますが、検体受領から前培養含め 2~4 日で、DNA 塩基配列解析に比べ低価格での報告が可能となります。
特にコストを重視されるお客様におすすめです。

同時または追加で DNA 塩基配列解析をご希望される場合に「MALDI 同時割引」をご用意しています。

受入可能な検体

カテゴリー必要量推奨培地培養時間・送付方法
細菌平板塗抹による
純粋培養物
(平板培地1 枚)
普通寒天培地、標準寒天
培地、SCD 寒天培地など
生育に適した平板培地
十分な生育を確認後、なるべく早くお送り下さい※1, 2。 純粋培養された平板培養物を“常温”でお送り下さい。 一旦冷蔵で保管された検体は、再培養後、常温でお送り 下さい。 解析対象とするコロニーの指定がある場合は、シャーレ 上に目印をして下さい。
酵母YM 寒天培地、SCD 寒天 培地など生育に適した平 板培地
カビ※4PDA やサブロー寒天など の栄養培地で十分な生育 が確認できる検体十分な生育を確認後、検体をお送り下さい※3。 一旦冷蔵で保管された検体も再培養は不要です。 解析対象とするコロニーの指定がある場合は、シャーレ 上に目印をして下さい。

※1 培養後、大幅に時間が経過している検体は解析に適しません。なるべく培養24~48時間の菌株をお送り下さい。
※2 混釈培養物および液体培養物は直接の解析ができません。再培養(有償)の後、解析をいたします。
※3 コンタミネーションなどで、直接解析ができない検体は、単離作業(有償)が必要となります(別途納期)。
※4 解析前に前培養を行いますので、培養後時間が経過している菌株でも生育が認められれば解析可能です。
※5 分析対象とするコロニーに必ず標付けをして下さい。分析対象が試験当日の13時までに確定できない場合は、翌日の解析とさせていただきます。

解析の流れ

  • 純度確認
  • 前培養 (カビの場合)
  • サンプル調製
  • 測定 ライブラリサーチ
  • レポート作成

使用データベース

【MBT compass Library】 V8.0.0.0 (7854)】

登録菌種数:細菌約2,503種(グラム陰性1,189種+グラム陽性1,314種)、酵母202種、カビ(糸状菌)43種

【MBT Filamentous Fungi Library】 V2.0 (468)
登録菌種数:カビ(糸状菌)152種

「Main Spectra(MSP)」を基本コンセプトとし、各菌株を複数回測定して各ピーク(分子量)とその強度の平均値を算出取得しています。マススペクトルのうち、検出頻度の低いピークはノイズとして除去して検出頻度の高い特徴的なピークのみを用いてデータベースを構成しています。同一菌種でも複数の菌株のマススペクトルデータが登録されているため、菌株間でマススペクトルパターンに多様性がある場合でも正確な同定が可能とされています。

納品内容・報告書サンプル

製品名報告内容
MALDI 微生物同定試験(Biotyper)・ データベースとの照合結果から推察される候補菌種(同定結果)と信頼値(スコア)
・ 候補菌種のバイオセーフティーレベル(BSL)
・ 参考データ:照合結果の相同性が高かった上位10 位までのデータベース登録菌株を示した結果レポート

価格・納期

製品名株数単位単価
(税抜)
納期
MALDI微生物同定試験(細菌 Biotyper)
MALDI微生物同定試験(酵母 Biotyper)
1~35,000円即日 18:00まで
(月~金曜日の正午までの検体着・オンライン納品に限る)
(当日12:00までの到着検体(純粋培養物に限る))
4~84,500円
MALDI微生物同定試験(カビ Biotyper)1~310,000円下記参照
4~89,000円
<オプション>
スペクトルパターン画像
11,000円+1営業日

カビ 試験・報告納期
検体到着日月曜日火曜日水曜日木曜日金曜日
試験・報告日※1,2木曜日又は金曜日翌週の月曜日または火曜日

※1 報告日が休業日の場合、翌営業日での報告となります。
※2 前培養(目安日数:2~3 日)において生育が充分と判断した日に試験を開始します。(翌日報告)試験の可否判断は、当社に一任下さい。

追加DNA塩基配列解析を各試験項目の12%割引にて承ります。


プラス「DNA塩基配列解析」でMALDI 微生物同定試験をカバーします!

DNA塩基配列解析と組み合わせることで、MALDI 微生物同定試験に登録のない菌種に対応いたします。

細菌・酵母の場合は、クラスター解析を組み合わせる事で菌種の推定が可能です。

ご依頼時、「試験と同時」、もしくは「試験の結果を見てから必要に応じて開始」から選択していただけます。「試験の結果を見てから必要に応じて開始」を選択していただき、DNA塩基配列解析を不要と判断され、追加分析を中止された場合には、DNA塩基配列解析の費用は生じません。

適用可能なDNA塩基配列解析

細菌 Rapid解析(DNA特急) 【16S rDNA-500 Rapid】
DNA塩基配列解析 【16S rDNA-500, 16S rDNA-500考察付】
酵母 Rapid解析(DNA特急) 【26S rDNA-D1/D2 Rapid, ITS rDNA Rapid】
DNA塩基配列解析 【26S rDNA-D1/D2, 26S rDNA-D1/D2考察付, ITS rDNA, ITS rDNA考察付】
カビ Rapid解析(DNA特急) 【「ITS rDNA Rapid, 28S rDNA-D1/D2 Rapid】
DNA塩基配列解析 【ITS rDNA, ITS rDNA考察付, 28S rDNA-D1/D2, 28S rDNA-D1/D2考察付】

ご依頼前の同意事項

ご依頼前の同意事項(共通) およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。

・ 見積書・注文書の取り交わしを省略し、依頼書および検体の到着をもって注文とし、試験を開始します。
・ 1依頼あたり、1日似実施可能な検体数は8株までです。
・ カビを試験する場合、サブロー液体培地による前培養が必須となります。即日報告ではありません。
・ コンタミネーションにより単離の必要がある検体は、別途有償での作業が必要となります。
・ 検体受付の前日の直近営業日 17:00までに依頼書の到着がない場合、所定の日数での報告ができないことがあります。
・ データベースの菌種の総タンパク質マススペクトルとのパターンマッチングによる解析のため、登録されている菌種と異なる菌種であっても、類似のマススペクトルを示した場合にはその菌種が被検体の同定結果として得られることがあります。また、登録されている菌種であっても、被検体のタンパク質組成によっては、同定結果が得られない、または異なる菌種名として同定結果が得られることがあります。
・ スラント、保存アンプル作製などの培養を含む追加試験を行う場合、別途、菌株の再送をお願いすることがあります。
・ カビ・酵母の場合、テレオモルフ(有性時代)とアナモルフ(無性時代)の判別はできません。
・ 非常に近縁な菌種または亜種の関係にある検体は、本試験により区別できないことがあります。
・ プロトコールは、ブルカージャパン株式会社の推奨に基づきます。
・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。

ご依頼は、以下のファイルをダウンロード頂きお申し込み下さい。