MALDI微生物同定試験（Biotyper）
特 長
- タンパク質マススペクトルパターンをデータベースと照合し同定
- DNA塩基配列解析と比較し、迅速、低価格での報告が可能
- 細菌、カビ（糸状菌）、酵母のすべてのカテゴリーの同定に対応
- バイオセーフティレベル付きで報告
- 当日12時(正午)までの到着検体 (細菌・酵母の純粋培養物に限る) は、即日納品
概 要
細菌、カビ、酵母のタンパク質マススペクトルを取得し、データベースと照合することで、検体の帰属種・近縁種を同定します。
MALDI-TOF MS法は、迅速性やコストの低さから臨床・食品・製薬など様々な分野で普及が進んでいます。
細菌および酵母では、当社営業日の午前中に到着し、検体が純化された平板培養物または、解析を実施するコロニーやカテゴリーが明確であった場合には、ご送付検体より直接解析を行い、即日報告が可能です。
カビの解析では、これまで再現性が課題とされていましたが、ブルカージャパン株式会社から提供された前処理プロトコルにより、再現性が格段に改善されました。
タンパク質抽出を効率よく行うために液体培地での培養が必須となりますが、検体受領から培養含め 2〜4日で報告が可能です。また、DNA塩基配列解析に比べ安価ですので、コストを重視されるお客様におすすめです。
同時または追加で D NA塩基配列解析をご希望される場合に「MALDI同時割引」を用意しています。
受入可能な検体
| カテゴリー | 必要量 | 送付方法 | 備考 |
|---|---|---|---|
| 細菌 | 平板塗抹による 純粋培養物 （平板培地1 枚） | 普通寒天培地、標準寒天培地、SCD寒天培地など生育に適した平板培地 | 十分な生育を確認後、なるべく早くお送り下さい。※1、2 純粋培養された平板培養物を“常温”でお送り下さい。 冷蔵により、タンパク質合成経路に変化が生じることから、一旦冷蔵で保管された検体は、再培養後、常温でお送り下さい。 試験対象とするコロニーのご指定がある場合は、シャーレ上に目印をして下さい。 |
| 酵母 | YM寒天培地、SCD寒天培地など生育に適した平板培地 | ||
| カビ※4 | PDAやサブロー寒天などの栄養培地で十分な生育が確認できる検体 | 十分な生育を確認後、検体をお送り下さい。※3 一旦冷蔵で保管された検体も再培養は不要です。 試験対象とするコロニーのご指定がある場合は、シャーレ上に目印をして下さい。 |
- 平板培養物中に複数のコロニーが存在する場合には、解析対象のコロニーに必ず目印をして下さい。
- カテゴリー変更やコンタミネーションなどに起因し、確認の連絡が必要な場合には、即日報告できない場合があります。
- 解析対象が試験当日の 13 時までに確定できない場合には、翌日解析とさせていただきます。
※1 培養後、大幅に時間が経過している検体は解析に適しません。可能な限り培養 24〜48 時間の微生物株をお送り下さい。
※2 混釈培養物は直接解析ができません。平板塗抹による再培養(有償)の後、解析となります。
※3 コンタミネーションなどで直接解析ができない検体は、単離作業(有償)が必要となります(別途納期)。
※4 当社にて解析前に培養を行いますので、培養後時間が経過している微生物株でも生育が認められれば解析可能です。
解析の流れ
- 純度確認
- 培養 （カビの場合）
- サンプル調製
- 測定 ライブラリサーチ
納品内容
| 試験項目 | 報告内容 |
|---|---|
| MALDI微生物同定試験 (Biotyper) | ・データベースとの照合結果から推察される候補菌種(同定結果) ・候補菌種のバイオセーフティーレベル(BSL) ・参考データ：相同性が高かった上位10位までのデータベース登録微生物株の結果レポート |
報告書サンプル
使用データベース
「Main Spectra(MSP)」を基本コンセプトとし、各微生物株を複数回測定して各ピーク(分子量)とその強度の平均値を算出取得しています。
マススペクトルのうち、検出頻度の低いピークはノイズとして除去して検出頻度の高い特徴的なピークのみを用いてデータベースを構成しています。
同一菌種でも複数株のマススペクトルデータが登録されているため、菌株間でマススペクトルパターンに多様性がある場合でも正確な同定が可能とされています。
| データベース | 登録菌種 |
|---|---|
| MBT Compass® Library | 細菌、酵母、カビ |
| MBT Filamentous Fungi Library | カビ（糸状菌） |
MBT Compass® Library は、Ver.10（細菌：2,982種、酵母：216種、カビ：41種）
MBT Filamentous Fungi Library は、Ver.3.0（カビ：180種）を使用しています。
価格・納期
| 製品名 | 株数 | 単位 | 単価 （税込） | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|
| MALDI微生物同定試験 （細菌 Biotyper） MALDI微生物同定試験 （酵母 Biotyper） | 1～3 | 株 | 5,500円 | 即日 18:00まで （月～金曜日の正午までの検体着で 純粋培養物・オンライン納品に限る） |
| 4～10 | 株 | 4,950円 |
||
| 11～20 | 株 | 翌営業日となる場合がございます | ||
| 21～ | 株 | お問合せ下さい | ||
| MALDI微生物同定試験（カビ Biotyper） | 1～3 | 株 | 11,000円 | 以下参照 |
| 4～10 | 株 | 8,800円 |
| カビ 解析・報告納期 | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| 検体到着日 | 月曜日 | 火曜日 | 水曜日 | 木曜日 | 金曜日 |
| 解析・報告日※1，2 | 木曜日又は金曜日 | 翌週の月曜日または火曜日 | |||
※1 報告日が休業日の場合、翌営業日での報告となります。
※2 培養(目安日数:2〜3日)において生育が充分と判断した日に解析を開始します(翌営業日報告)。解析の可否判断は、当社に一任下さい。
DNA塩基配列解析と組み合わせることで、MALDI微生物同定試験に登録のない菌種に対応いたします。
ご依頼時、「試験と同時」または「試験の結果を見てから必要に応じて開始」をご選択いただけます。「試験の結果を見てから必要に応じて開始」をご選択いただき、DNA塩基配列解析は不要と判断され、追加解析を中止された場合には、DNA塩基配列解析の費用は生じません。
<オプション> 形態観察 ・ クラスター分析
形態観察は、検体の培養後、細菌、放線菌、酵母、カビの顕微鏡写真を撮影し、観察結果を報告いたします。当社で
の培養確認が必須となります。
クラスター分析は、お客様専用のユーザーデータベースを作成し、登録したスペクトルデータからデンドログラムを作
成し、検体間の類似度を可視化します。
MALDI Biotyperのクラスター分析の場合、「●％以上で同一種」といった明確な数値基準がないため、デンドログラムから各検体の種の異同を判断することはできませんが、複数の検体を大まかにグルーピングすることが可能です。また、M ALDI微生物同定試験で同定できなかった検体をDNA塩基配列解析し、クラスター分析の結果に反映させることで、未同定株の種を推定することも可能です。
スペクトルパターンでは、PDF形式のマススペクトルデータの画像とExcel形式のピークリストを出力し、報告します。
| 試験項目 | 報告内容 | 単価（税込） | 目安納期 |
|---|---|---|---|
| 細菌形態観察 | コロニーの色調、細胞形態・グラム染色性 および芽胞形成能 (培養24～48時間) を 観察し、写真を撮影します。 | 7,700円 | 8営業日 |
| 放線菌形態観察 | コロニー形態、色調、菌糸 および胞子等の細胞形態を 顕微鏡で観察し、写真を撮影します。 | 13,200円 | 20営業日 |
| 酵母形態観察 | コロニー形態、細胞形態を 顕微鏡で観察し、写真を撮影します。 | 17,600円 | 17営業日 |
| カビ形態観察 | コロニー形態、色調、菌糸および胞子等の 細胞形態を顕微鏡で観察し、 帰属分類群を推定する上で 重要となる形態的特徴を観察し、 写真を撮影します。 | 17,600円 | 19営業日 |
| クラスター分析※1，2、3 | お客様専用のユーザーデータベースを作成し、 登録したスペクトルデータから クラスター分析を行います。 デンドログラムを作成することで、 検体間の類似度が可視化できます。 | ＋3,300円 | ＋2営業日～ |
| スペクトルパターン (画像＋ピークリスト) | マススペクトルデータの画像 (PDF形式) と ピークリストを (Excel形式) を出力します。 | ＋3,300円 | ＋1営業日～ |
クラスター分析
3検体以上からクラスター分析が可能です。指定の検体のマススペクトルデータをお客様専用のMALDIユーザーデータベースに追加登録の上、クラスター分析を行います。
スペクトルパターン（画像+ピークリスト）
※1 3検体以上からクラスター分析が可能です。指定の検体のマススペクトルデータをお客様専用のMALDIユーザーデータベースに追加登録の上、クラスター分析を行います。
※2 MALDI微生物同定試験と同時依頼に限ります。クラスター分析の結果はMALDI微生物同定試験の報告書に含みます。
※3 データベースの株数が100株以上となる場合には、納期を延長させていただくことがございます。
「MALDI Biotyper」、「MBT Compass」はBruker Daltonik GmbHの登録商標です。
ご依頼、依頼書の入手、ご依頼前の同意事項
ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。
- 見積書・注文書の取り交わしを省略し、依頼書および検体の到着をもって注文とし、解析を開始します。
- 10検体までは「即日18時まで」、11～20検体は「即日または翌営業日18時まで」の報告となります。21検体以上の場合には、お問合せ下さい。
- 報告書分冊の場合は、ご依頼の際にご指示をいただく必要があります。また、報告日は翌営業日となる場合があります。
- 報告書に付属の結果データファイルの検体ごとの分割はできません。
- カビの解析を行う場合、サブロー液体培地による培養が必須となります。即日報告ではありません。
- コンタミネーションにより単離の必要がある検体は、別途有償での作業が必要となります。
- 検体受付の前日の直近営業日17:00までに依頼書の到着がない場合、所定の日数での報告ができないことがあります。
- データベースの菌種のタンパク質マススペクトルとのパターンマッチングによる解析のため、登録されている菌種と異なる菌種であっても、類似のマスス
ペクトルを示した場合にはその菌種が検体の同定結果として得られることがあります。また、登録されている菌種であっても、検体のタンパク質組成によっては、同定結果が得られない、または異なる菌種名として同定結果が得られることがあります。 - スラント、保存アンプル作製などの培養を含む追加試験を行う場合、別途、検体の再送をお願いすることがあります。
- カビ・酵母の場合、テレオモルフ(有性時代)とアナモルフ(無性時代)の判別はできません。
非常に近縁な菌種または亜種の関係にある検体は、本解析により区別できないことがあります。 - プロトコルは、ブルカージャパン株式会社の推奨に基づきます。
- ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。
ご依頼、依頼書の入手
ご依頼は、以下の依頼フォーム、もしくはファイルよりお申し込み下さい。
ファイルのダウンロードはこちら
分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）
およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認しました。
・混釈培養物で直接解析ができない場合、再培養（有償）の後、解析をいたします。
・コンタミネーションなどで、直接解析ができない検体は、単離作業(有償)が必要となります（別途納期）。
・分析対象が試験当日の13時までに確定できない場合は、翌日の解析とさせていただきます。