生体・環境関連 群集構造データ解析

アンプリコンシーケンスデータ解析 (Metagenome@KIN)

アンプリコンシーケンス解析により得られた配列データの帰属分類群をMetagenome@KINによりデータ解析します。

アンプリコンシーケンスデータ解析 (QIIME2)

アンプリコンシーケンス解析により得られた配列データから、代表配列の決定、多様性をQIIME2により解析します。

統計分析ソフトRによるデータ解析

群集組成の特徴や異同を示す作図、統計学的検定を統計分析ソフトウェア"R"で実施します。論文投稿や学会発表向けにデータを活用できます。

PICRUSt2による予測メタゲノム解析

PICRUSt2により検体に含まれる細菌叢が持つ遺伝子の機能を予測します。ショットガンメタゲノム解析の代替法として利用されています。