執筆者 tslseeqadmin | 10月 26, 2023 | 技術情報, 技術情報_群集構造解析
アンプリコンシーケンス解析 MiSeqデータ取得方法・解析前処理工程の一部変更のご案内 ホーム / 技術情報 変更による解析結果への影響はございません。 アンプリコンシーケンス解析で使用しているMiSeq (Illumina, USA) につきまして、イルミナ社より機器搭載OSおよびコントロールソフトウェアのアップグレードが発表されました1)。これに伴い2021年6月7日ご依頼分より、当社アンプリコンシーケンス解析における配列データ (fastq)...
執筆者 tslseeqadmin | 10月 26, 2023 | 技術情報, 技術情報_群集構造解析
Metagenome@KINソフトウェアをバージョンアップしました。 ホーム / 技術情報 ソフトウェアをバージョンアップしました。 Metagenome@KINソフトウェアをVer.2.21からVer.2.3に更新したことで、以下の解析可能になりました。 分類階級 (界から種レベル) ごとにα多様性指数を出力できるようになりました。 Simpson’s Index, Shannon Entropyを出力します。微生物群集の多様性を考察できるようになりました。 ヒートマップ・クラスター分析結果の仕様が変更されます。...
執筆者 tslseeqadmin | 10月 26, 2023 | 技術情報, 技術情報_群集構造解析
糞便中有機酸分析で使用しているシステムについて ホーム / 技術情報 2020年4月に有機酸分析システムを追加導入しました。 同一の糞便検体について従来機と新型機で測定した結果。新型機は従来機と同等の測定値が得られることがわかりました。 有機酸分析システムについて 糞便中有機酸分析について、多くのお客様にご利用いただいており、さらなる分析速度の向上のために2020年4月に有機酸分析システムを追加導入いたしました (表1)。 同一の糞便検体について従来機と新型機で測定した結果...
執筆者 tslseeqadmin | 10月 26, 2023 | 技術情報, 技術情報_群集構造解析
アンプリコンシーケンス解析用データベースの更新（V16.0→V17.0） ホーム / 技術情報 解析用データベースが新しくなりました アンプリコンシーケンス解析で使用する当社オリジナルデータベースが「NGS-DB-BA16.0」(Ver.16)から最新版「NGS-DB-BA17.0」(Ver.17) へバージョンアップし、2023年1月より順次新しいデータベースを使用して解析結果を報告いたします。 Not Determinedの減少および最新の分類体系を反映 Bacillus subtilis groupやB. cereus...
執筆者 tslseeqadmin | 10月 26, 2023 | 技術情報, 技術情報_群集構造解析
当社採便容器の保存液によるコロナウイルス不活化検証済み ホーム / 技術情報 / 技術情報_群集構造解析 コロナウイルス感染者の糞便からは、最初の症状が現れてから平均28 日後までコロナウイルスが検出 (口腔と比べ11 日程⾧い) されます (Wu et al. 2020)。また、糞便中のコロナウイルスは、手などを介した糞便－経口感染の可能性があることが報告されています(Guo et al. 2021)。...
執筆者 tslseeqadmin | 10月 26, 2023 | 技術情報, 技術情報_群集構造解析
糞便・腸管内容物からのDNA抽出方法の一部変更のご案内 ホーム / 技術情報 / 技術情報_群集構造解析 説明 当社では、DNA抽出のご依頼の増加に対応するためビーズ式ホモジナイザーPrecellys Evolution (Bertin Instruments, 以下Precellysと略) を導入いたしました。Precellysを使用した菌叢解析 (アンプリコンシーケンス解析) は、一例としてUchiyamaら1. により行われています。 このPrecellysでの処理条件を検討し、これまで使用しているビーズ式組織・細胞破砕装置...
