生体 アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル)

※ 血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
※ ヒト以外の糞便検体でのDNA抽出はご相談下さい。

※保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。保管温度帯は腸内環境用糞便採取キット・採取容器のページをご参照下さい。

※　JMBC 推奨プロトコルはシーケンスによる配列決定までとなります。

*1　3万リード取得を目安に解析を実施しますが、獲得できる配列数は検体の性状により変動します。
*2　データ解析は、セット1またはセット2のどちらかをご選択下さい。
*3　RDP (Ribosomal Database Project)、Greengenes databaseおよびSILVA databaseは公共の解析データベースです。
*4　セット2 (QIIME2) は一次解析までの報告です。二次解析 (多様性解析、統計解析) は、別途追加解析のご指示を下さい。
*5　GreengenesまたはSILVAのどちらかをご選択下さい。データベースの違いによる結果の違いについては、当社では考察しません。

• セット2をご選択いただいた場合、多様性解析や統計解析(二次解析)が可能です。費用は一式 ＋30,000円 (税抜) 納期は＋5営業日となります。

*1　 PCR増幅が確認されないなど検体の性質に帰因する不具合により作業のやり直しが発生する場合は納期を延長させていただく場合があります。
*2　 リアルタイムPCR解析などを同時にご依頼いただく場合、DNA抽出の重複費用として1検体あたり6,000円（税抜）を減額します。

従来機MiSeqでの解析をご希望のお客様は、本ページ下部の「従来機MiSeqでの解析」用依頼書をダウンロードして、必要事項をご記入のうえ、ご依頼ください。

なお、今回の切り替えにあたり、MiSeqとMiSeq i100シリーズの比較解析を当社にて実施いたしました。
結果を以下よりご確認いただけますので、ご検討の際の参考資料としてぜひご覧ください。
▶　MiSeq®とMiSeq® i100シリーズの比較解析結果（当社実施）

※異なるシーケンサープラットフォームの利用による結果の違いについては、当社では考察しません。あらかじめご了承ください。

■価格・納期

• セット2をご選択いただいた場合、多様性解析や統計解析(二次解析)が可能です。費用は一式 ＋30,000円 (税抜) 納期は＋5営業日となります。

■仕様

*1　クオリティーフィルタリング、キメラチェック後のリード数です。
*2　データ解析は、セット1またはセット2のどちらかをご選択下さい。
*3　RDP (Ribosomal Database Project)、Greengenes databaseおよびSILVA databaseは公共の解析データベースです。
*4　セット2 (QIIME2) は一次解析までの報告です。二次解析 (多様性解析、統計解析) は、別途追加解析のご指示を下さい。
*5　GreengenesまたはSILVAのどちらかをご選択下さい。データベースの違いによる結果の違いについては、当社では考察しません。

１）Tourlousse DM, Narita K, Miura T, Sakamoto M, Ohashi A et al . Validation and standardization of DNA extraction and library construction methods for metagenomics-based human fecal microbiome measurements. Microbiome 2021;9:95.

２）JMBC 糞便メタゲノム解析推奨プロトコル ver2.1.
http://www.jmbc.life/news/images/SOPv1.2.pdf