カビPremium

特長

  • 遺伝子解析結果と形態観察の総合考察付きセットメニュー

  • コロニー形態および細胞形態観察結果の顕微鏡写真付きで報告

  • Aspergillus 属およびPenicillium 属に特化したメニューも用意

  • 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル付きで報告

概要

カビの帰属種・近縁種を同定する際、当社がお薦めする試験セットです。「DNA塩基配列解析 (考察付) 」と「形態観察」などの性状試験を組み合わせますので、遺伝子解析単独での試験よりもより深い考察が可能となります。学会発表や特許取得などの研究や製品開発など、微生物株について、より詳細な情報を必要とするお客様に有効となり、近縁種の推定と分類学的な特徴付けが可能です。

また、 Aspergillus 属やPenicillium 属では、rDNAのITS領域の塩基配列解析のみでは近縁種が区別できない例も多数報告されており、これらの分類群については、β-tubulinまたはcalmodulin遺伝子などの進化速度のより速い機能遺伝子を用いた解析が有効となります。当社では、これらの分類群のより詳細な同定をご希望されるお客様には、「機能遺伝子のDNA塩基配列解析」と「形態観察」のセットもあります。

受入可能な検体

種類

必要量

備考

平板培養物

1 枚

当社での培養確認を必須とします。 培養条件をご指示下さい。
生育性や純粋性に疑義がある場合には、 ご連絡します。

液体培養物
スラント ( 斜面培養物 )
アンプル ・ グリセロールストック

1 本

解析の流れ

  • 培養・純度確認

  • DNA抽出

  • PCR増幅

  • シーケンス (ITS rDNA)

  • 塩基配列決定

  • 相同性検索

  • 分子系統解析

  • カビ第一段階試験

  • 文献調査

  •  総合考察

納品内容

試験項目

報告内容

付属データ

カビ Premium

・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位
・ 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位
・ 系統樹 (rDNAのITS領域※1, 2)
・ カビ第一段階試験結果
・ 総合考察 (同定に至った経緯の文章説明)
・ 同定結果
・ 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル

・ 巨視観察像 (コロニー)
・ 微視観察像 (形態)
・ DNA塩基配列データ
・ シーケンス波形データ

カビ Premium
(Aspergillus 属 )
カビ Premium
(Penicillium 属 )

・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 (ITS rDNA)
・ 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位 (ITS rDNA)
・ 系統樹 (rDNAのITS領域)
・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 (機能遺伝子)
・ 系統樹 (β-tubulinまたはcalmodulin遺伝子)
・ カビ第二段階試験結果
・ 総合考察 (同定に至った経緯の文章説明)
・ 同定結果
・ 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル

・ 巨視観察像 (コロニー)
・ 微視観察像 (形態)
・ 分子系統樹ファイル
(機能遺伝子:PowerPoint)
・ DNA塩基配列データ
・ シーケンス波形データ

※1 ITS領域は、28S rDNA-D1/D2領域に変更可能です。
※2 ITS領域と28S rDNA-D1/D2領域の2遺伝子の解析に変更可能です。なお、解析は遺伝子領域ごとに行います。

報告書サンプル

SAMPLE/16S rDNA-500 (BLAST) 報告書v1.12のサムネイル

価格・納期

試験項目

単位

単価(税抜)

中間報告※

目安納期

カビ Premium (1 遺伝子 )

66,000 円

10 営業日

25 営業日

カビ Premium (2 遺伝子 )

71,400 円

10 営業日

30 営業日

カビ Premium (1 遺伝子 ) /DNA 特急

86,000 円

5 営業日

25 営業日

カビ Premium
(Aspergillus属 )
カビPremium
(Penicillium属 )

201,000 円

15 営業日

36 営業日

※ 中間報告は、「相同性検索結果の上位5位」をE-メール、またはFAXで報告します。報告書の結論と異なることがあります。

  • 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】 追加費用のご案内をご参照下さい。
  • DNA特急は、5営業日で「相同性検索結果の上位5位」を中間報告します。また、一度にお受けできる検体数は8株までです。
  • 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
  • DNA塩基配列データ、シーケンス波形データ、コロニーおよび形態観察時の写真などは、報告書と一緒に納品します

ご依頼前の同意事項

・ 担子菌類や卵菌類 (ミズカビ類) などの生育が微弱な微生物株、特殊な培養条件に起因して形態観察による特徴付けが困難となる微生物株では、形態観察が行えないことがあります。
・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
・ 検体の生育性の有無や培養時間は、その菌の性状に依存します。当社は試験の遂行に最善の努力を払いますが、実施の確実性を保証するものではありません。
・ 培養条件や培養スケールの違いにより、菌株の性状が変化する可能性があります。これらの試験結果への影響について、当社は保証するものではありません。
・ 培養は、お客様のご指定、または当社で適当と判断した培養条件で行いますが、十分な生育が得られることを当社は保証するものではありません。
・ バイオセーフティレベルは、「細菌:日本細菌学会バイオセーフティ指針」、「カビ・酵母:Atlas of clinical fungi」または「各保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外との情報が異なる場合があります。
・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
・ バイオセーフティレベル (BSL) は、各微生物種に対し定められています。報告書で示すBSLは目安であり、検体自体のBSLを示すものではありません。
・ PCR時のポリメラーゼ反応エラーおよびシーケンサーのシグナル強度に起因する混合塩基の判定、ばらつきにおける試験結果への影響は考慮しておりません。
・ 検体の状態によりPCR増幅ができないことがあります。