細菌Premium
特長
-
DNA塩基配列解析結果と生理・生化学的性状試験のセットメニュー
-
DNA塩基配列解析の結果を踏まえ 分類学的な特徴付けに有効な生理・生化学的性状試験項目を選定
-
帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル付きで報告
概要
16S rDNAの全長解析である「16S rDNA-Full」と「形態観察」や「生理・生化学的性状試験」などの性状試験を組み合わせたメニューです。DNA塩基配列解析のみの試験に比べ、より精度の高い帰属種・近縁種の推定が期待できます。学会発表や特許取得の際のデータ取得など、微生物株についてより詳細な情報を必要とするお客様に有効となり、当該微生物株の分類学的な特徴付けが可能です。
受入可能な検体
種類 | 必要量 | 備考 |
平板培養物 | 1 枚 | 当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。 |
液体培養物 | 1 本 |
解析の流れ
-
培養・純度確認
-
DNA抽出
-
PCR増幅
-
シーケンス
-
塩基配列決定
-
相同性検索
-
分子系統解析
-
文献調査
-
細菌第一段階試験
-
細菌第二段階試験
納品内容
試験項目 | 報告内容 | 付属データ |
細菌 Premium | • 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 • 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位 • 系統樹 • 細菌第一段階試験結果 • 細菌第二段階試験結果 • 帰属種・近縁種の同定に有効な追加試験 • 同定結果 • 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル | • コロニー像 |
報告書サンプル
価格・納期
試験項目 | 単位 | 単価 ( 税抜 ) | 中間報告※ | 目安納期 |
細菌 Premium | 株 | 115,000 円 | 10 営業日 | 30 営業日 |
細菌 Premium/DNA 特急 | 株 | 125,200 円 | 5 営業日 |
※ 中間報告は、当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をE-メールで報告します。報告書の結論と異なる可能性があります。
- 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】 追加費用のご案内をご参照下さい。
- DNA特急は、5営業日で当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をE-メールで報告します。また、一度にお受けできる検体数は8株までです。
- 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
- DNA塩基配列データ、シーケンス波形データ、コロニーおよび形態観察時の写真などは、報告書と一緒に納品します。
<オプション> 総合考察
- オプションで考察 (同定に至った経緯の文章説明) 付きに変更が可能です。
試験項目 | 報告内容 | 単位 | 単価（税抜） | 目安納期 |
総合考察 | 同定に至った経緯の文章説明を追加します。 | 株 | ＋ 11,000 円 | ＋ 2 営業日～ |
ご依頼前の同意事項
・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
・ 検体の生育性の有無や培養時間は、その菌の性状に依存します。当社は試験の遂行に最善の努力を払いますが、実施の確実性を保証するものではありません。
・ 培養条件や培養スケールの違いにより、菌株の性状が変化する可能性があります。これらの試験結果への影響について、当社は保証するものではありません。
・ 培養は、お客様のご指定、または当社で適当と判断した培養条件で行いますが、十分な生育が得られることを当社は保証するものではありません。
・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベルを示すものではありません。
・ PCR時のポリメラーゼ反応エラーおよびシーケンサーのシグナル強度に起因する混合塩基の判定、ばらつきにおける試験結果への影響は考慮しておりません。
・ 検体の状態によりPCR増幅ができないことがあります。