化学的性状分析
説明
分類学において、化学的性状は重要な分類学的特徴付けの1つです。当社では以下の化学的性状分析が可能です。
試験内容
| 項目 | 概要 |
| 菌体脂肪酸組成分析 （MIIDIシステム） | 菌体脂肪酸組成分析システム“Sherlock Microbial Identification System”（MIDI社製、ガスクロマトグラフィー）を使用した“MIDI法”により、構成脂肪酸の検出および照合をします。Alicyclobacillus属など、MIDI法でデータベース化されていない脂肪酸の特定はできません。データベースにない菌群についてはお問い合わせ下さい。 |
| 細胞壁アミノ酸組成分析 | 細胞壁に特徴的なアミノ酸（リジン、オルニチン、ジアミノピメリン酸など）を、液体クロマトグラフィーにより検出し、構成アミノ酸を決定します。前述以外のアミノ酸（ヒドロキシグルタミン酸など）を希望される場合は、お問い合わせ下さい。 |
| キノン分析 | 主なユビキノン（Q）、メナキノン（MK）の分子種およびプラストキノン-9を液体クロマトグラフィーにより同定します。複数種のキノンを保持する場合には、その存在割合（mol％）を報告します。MK-11, MK-12, MK-13, MK-14など（MK-n （n>11））のキノン分子種の同定をご希望の方は、お問い合わせ下さい。 |
| リン脂質分析 | 菌体に含まれる主なリン脂質（ホスファチジルエタノールアミン（PE）、ホスファチジルコリン（PC）など）を二次元薄層クロマトグラフィー（TLC）により検出します。検出されたリン脂質は標準物質と比較し、分子種を決定します。TLCの分離展開像と分子種を報告します。スフィンゴ脂質などの検出を希望される場合は、お問い合わせ下さい。 |
| G+C含量測定 | DNAは、二重らせん構造でアデニン（A）とチミン（T）、グアニン（G）とシトシン（C）が結合しています。これらのうち、GおよびCの含量を測定します。G+C含量は、帰属種により約25～75mol％の幅広い値をとるため、分類学的に有効な指標とされています。液体クロマトグラフィーにより分析を行い、全塩基に対するGC対の割合を算出します。 |
報告内容・報告書サンプル
| 項目 | 概要 | 参考データ |
| 菌体脂肪酸組成分析 （MIIDIシステム） | ・脂肪酸組成プロファイル ・クロマトグラム | ・結果表 （クロマトグラムは含みません） |
| 細胞壁アミノ酸組成分析 | ・検出アミノ酸の保持時間とピーク面積 ・クロマトグラム ・構成アミノ酸結果 | ・結果表 ・クロマトグラム |
| キノン分析 | ・保有キノン種結果（mol%） | ・結果表 |
| リン脂質分析 | ・薄層クロマトグラフィー展開像 ・主要リン脂質成分 | ・展開像 |
| G+C含量測定 | ・G+C含量測定結果 | ・結果表 |
報告内容・報告書サンプル
| 区分 | 項目 | 概要 | 送付方法 |
| 培養物 (培養～) | 全分析共通 | 平板培地 1枚 （または斜面培地 1本） | 純粋培養された平板培養物、または斜面培養物を常温もしくは冷蔵（クール便）でお送り下さい。 |
| 集菌体 (抽出～) | 菌体脂肪酸組成 | 目安湿重量：0.5g以上 （100μｌ程度の菌体ペレット） | 集菌後、生理食塩水で2～3回洗浄して下さい。寒天培地から集菌される場合、寒天培地を回収しないようご注意下さい集菌・洗浄後は凍結し、冷凍（クール便）にてお送り下さい。 |
| キノン | 目安湿重量：1g以上 | 集菌後、5mM EDTAバッファで2～3回洗浄して下さい。 集菌・洗浄後は凍結し、冷凍（クール便）にてお送り下さい。 | |
| G＋C含量 | 目安湿重量：1g以上 | ||
| 細胞壁アミノ酸組成 | 目安湿重量：3g以上 | ||
| リン脂質 | 目安湿重量：3g以上 | ||
| 凍結乾燥品 (抽出～) | 菌体脂肪酸組成 | 凍結乾燥品重量：0.3g以上 | 集菌後、生理食塩水で2～3回洗浄し、直ちに凍結乾燥して下さい。常温にてお送り下さい。 |
| キノン分析 | 凍結乾燥品重量：1g以上 | ||
| リン脂質 | 凍結乾燥品重量：1g以上 | ||
| 調整済み品 (分析～) | リン脂質以外 | お問い合わせください。 | |
価格・納期
| 項目 | 検体数 | 単位 | 培養品（培養～） | 集菌体（抽出～） | 調整済み品（分析～） | |||
| 単価 | 目安納期 | 単価 | 目安納期 | 単価 | 目安納期 | |||
| 菌体脂肪酸組成 | 1 | 株 | 41,000円 | 12営業日 | 33,000円 | 9営業日 | 23,000円 | 9営業日 |
| 2 | 株 | 26,000円 | 20,000円 | 14,000円 | ||||
| 3～ | 株 | 20,000円 | 15,000円 | 11,000円 | ||||
| 菌体脂肪酸組成/近縁種文献調査 | 一分類群（調査）あたり 35,000円/分類群 ＋5営業日 | |||||||
| 細胞壁アミノ酸組成 | 1 | 株 | 107,000円 | 23営業日 | 72,000円 | 20営業日 | 37,000円 | 15営業日 |
| 2 | 株 | 74,000円 | 53,000円 | 29,000円 | ||||
| 3～ | 株 | 63,000円 | 47,000円 | 26,000円 | ||||
| ヒドロキシグルタミン酸追加分析 | ＋42,000円/株 ＋15営業日 | |||||||
| キノン分析（細菌） | 1 | 株 | 69,000円 | 20営業日 | 59,000円 | 15営業日 | 36,000円 | 13営業日 |
| 2 | 株 | 44,000円 | 36,000円 | 22,000円 | ||||
| 3～ | 株 | 36,000円 | 29,000円 | 18,000円 | ||||
| クロマトグラム追加 | ＋5,000円/株 ＋4営業日 | |||||||
| キノン追加分析/MK-11～14 | ＋11,000円/株 ＋3営業日 | |||||||
| キノン分析（菌類） | 1 | 株 | 71,000円 | 20営業日 | 61,000円 | 15営業日 | 36,000円 | 13営業日 |
| 2 | 株 | 45,000円 | 38,000円 | 22,000円 | ||||
| 3～ | 株 | 37,000円 | 30,000円 | 18,000円 | ||||
| クロマトグラム追加 | ＋5,000円/株 ＋4営業日 | |||||||
| リン脂質分析 | 1 | 株 | 151,000円 | 20営業日 | 125,000円 | 18営業日 | － | － |
| G+C含量測定 | 1 | 株 | 44,000円 | 20営業日 | 35,000円 | 18営業日 | 26,000円 | 18営業日 |
| DNA-DNAハイブリッド形成試験と同時依頼の場合： 21,000円 | ||||||||
・調製済みとは、分析に直接、供試できる検体を示します。当社での再調製が必要な場合、別途追加費用が必要となることがあります。
・常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などを指定の場合、追加費用が必要となります。（培養追加費用→ 【ガイド】検体送付と追加費用のご案内を参照下さい）
・純粋性に不安がある場合、分析を行う前にDNA塩基配列解析（シーケンスまでで可能）などの試験により、純粋性を確認されることをお薦めします。
・細胞壁アミノ酸組成のヒドロキシグルタミン酸追加分析、キノン分析のキノン追加分析/MK-11～14は、主にMicrobacterium属などが対象となります。
・G+C含量の測定は、DNA調製1回、液体クロマトグラフィーにて3回繰り返し測定（n=3）を行った値およびその平均値が分析結果となります。
依頼書の入手と同意事項の確認
ご依頼前の同意事項、ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。
・ 菌体脂肪酸組成/近縁種の文献調査の場合、DNA塩基配列解析などの結果に基づいた近縁種の情報を提供下さい。近縁種の文献を入手し主要な菌体脂肪酸組成を比較します。分類群によっては文献記載がなく、近縁種の菌体脂肪酸組成の情報が得られないことがあります。
・ ご依頼前の同意事項（共通）を必ずご確認下さい。
分析のご依頼は、以下のファイルをダウンロード頂きお申し込み下さい。
