生体関連 リアルタイムPCR 解析（定量）
特 長
- 当社保有のプライマーセットを用いて目的対象とする微生物の鋳型DNAの量 (コピー数) を推定
- 腸内細菌、口腔内細菌、皮膚常在菌、食品関連や環境関連の微生物を対象
- オリジナルプライマーを含むプライマーを多数保有
- 微量な検体からでも正確な推定が可能
概 要
検体中に含まれる特定分類群の遺伝子を、リアルタイムPCR装置により指数関数的に増幅するDNAの量をリアルタイムにモニタリングします。全細菌 (全アーキア) のコピー数と比較することで、検体中の標的菌群の割合を推定可能です。
参考文献
1) Nakayama J, Tanaka S, Songjinda P, Tateyama A, Tsubouchi M et al. Analysis of infant intestinal microbiota by various kinds of molecular approaches -Toward large scale epidemiological investigations correlating allergy development with intestinal microbiota-. J Intestinal Microbiol 2007;21:129–142.
2) Farrelly V, Rainey FA, Stackebrandt E. Effect of genome size and rrn gene copy number on PCR amplification of 16S rRNA genes from a mixture of bacterial species. Appl Environ Microbiol 1995;61:2798–2801.
3) Fogel G, Collins C, Li J, Brunk C. Prokaryotic genome size and SSU rDNA copy number: estimation of microbial relative abundance from a mixed population. Microb Ecol 1999;38:93–113.
受入可能な検体
対象
必要検体量・送付方法
| 検体の種類 | 必要量 | 留意点および送付方法 | ||
|---|---|---|---|---|
| A区分 | 糞便、腸管内容物、 ルーメン液 | 採便容器(保存液なし) もしくは気密性の高い容器 | 0.2～0.5 g | 採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送 |
| メタボロキーパー※1 | 採取後速やかに冷蔵保存 冷蔵輸送推奨、常温輸送可 | |||
| B区分 | A区分以外 (口腔内容物(唾液、プラーク)、 皮膚拭取物など) | スワブ メタフロキーパー（皮膚） 1.5 mLチューブなど | 0.2～1 mL (唾液) | 唾液、舌苔、口腔粘膜、プラークを採取し、 速やかに冷凍保存、冷凍輸送 |
| 綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液（PBS、生理食塩水、滅菌水など）に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送 | ||||
| DNA抽出物※2 | 濃度：10 ng/µL 容量：30 µL (1プライマー追加 ごとに＋15 µL以上) | 抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送 | ||
※1 メタボロキーパーを用いてのご依頼の場合には糞便中有機酸分析が必要になります。
※2 DNA抽出物は、PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。
糞便検体の返送
糞便、唾液などの生体由来検体の返送をご希望のお客様には、定温マルチBOXによる臨床検体輸送サービスを利用してお送りいたします。
| 項目 | 容器サイズ(内寸) | 単位 | 価格(税込) | |
|---|---|---|---|---|
| 生体由来検体返送(冷凍) | 10サイズ | 230mm×230mm×200mm | 1個 | 42,460円 |
| 追加 1個 | +15,015円 | |||
| 50サイズ | ||||
| 320mm×450mm×350mm | 1個 | 73,370円 | ||
| 追加 1個 | +44,770円 | |||
作業の流れ
- DNA抽出
- DNA精製
- PCR増幅(インターカレーター法)
- PCR増幅産物モニタリング
仕 様
リアルタイムPCR装置を用いて、ご指定いただいたプライマーでPCR増幅し、目的とする微生物のDNA量(コピー数)を絶対定量します。
納品内容・報告書サンプル
| 報告内容 | 付属データ |
|---|---|
| 遺伝子コピー数(定量値) | Excelファイル |
解析可能な対象分類群および遺伝子(当社保有プライマー)
価格・納期
| 試験項目 | 内容（解析例） | 単位 | 単価 （税込） | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|
| リアルタイムPCR解析（定量） | 検体数1、1プライマーの場合 | 検体 | 53,900円 | 15営業日～ |
| 検体数2、2プライマーの場合 | 検体 | 48,400円 |
||
| 検体数5、2プライマーの場合 | 検体 | 29,700円 |
||
| 検体数10、2プライマーの場合 | 検体 | 24,200円 |
||
| ＜オプション＞ プライマー設計 | - | 式 | 42,900円 | ＋10営業日 |
メタボロキーパーを用いてのご依頼の場合には糞便中有機酸分析が必要になります。
ご依頼前の同意事項
ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。
- 新たにプライマーを合成する場合、合成費用や菌株購入費用、スタンダード作製費用が必要となります。
- リアルタイムPCR解析の16S rRNA遺伝子は，細菌種により保有している量 (コピー数) が異なるため、16S rDNA のコピー数が実際の細菌数と等しいわけではない点を考慮すべきであると考えられています1)-3)。
- ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
ご依頼は、以下のファイルをダウンロード頂きお申し込み下さい。
ご依頼、依頼書の入手
- 生体関連A区分の依頼書はコチラ
分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）
およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認しました。
- 生体関連B区分の依頼書はコチラ
分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）
およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認しました。
DNA抽出物でご依頼のお客様は、抽出元の検体が該当する区分に当てはまるご依頼書をご利用下さい。