生体A DNA 抽出 (JMBC 推奨プロトコル)
特長
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JMBC（日本マイクロバイオームコンソーシアム）推奨プロトコルに基づき、DNAを抽出し納品
概要
受入可能な検体
検体由来 | 由来 | 検体の種類※ |
A 区分： 糞便検体 | ヒト | 糞便 |
※ 血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
※ ヒト以外の糞便検体でのDNA抽出はご相談下さい。
必要検体量・送付方法
検体の種類 | 必要量 | 留意点および送付方法 | ||
A区分 | 糞便 | 糞便採取容器 ( 保存液なし ) | 0.2 ～ 0.5 g | 採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送 |
糞便採取容器 ( 保存液あり ) | 採取後速やかに冷蔵保存 | |||
・保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。
・冷凍する場合の保管温度帯は腸内環境分析用 糞便採取キット・採取容器のページをご参照下さい。
作業の流れ
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検体の秤量（オプション）
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破砕
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精製
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濃度測定
仕様
使用機器またはキット | 内容 |
・ ISOSPIN Fecal DNA | 糞便からの DNA 抽出～精製を実施します。 |
納品内容
TEバッファーに溶解したDNAを70 μL以上納品します。吸光度測定によるDNA濃度測定結果を報告します。
報告納品内容 | 形式 |
DNA 抽出物 | マイクロチューブ |
DNA 濃度測定結果 | Excel ファイル |
報告書サンプル
価格納期
試験項目 | 区分 | 検体数 | 単位 | 単価（税抜） | 目安納期 |
DNA抽出 (JMBC 推奨プロトコル ) | A 区分 | 1 | 検体 | 12,000 円 | 15 営業日～ |
参考文献
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(1)
Tourlousse DM, Narita K, Miura T, Sakamoto M, Ohashi A et al . Validation and standardization of DNA extraction and library construction methods for metagenomics-based human fecal microbiome measurements.Microbiome 2021;9:95.
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(2) JMBC糞便メタゲノム解析推奨プロトコル ver2.1.
http://www.jmbc.life/news/images/SOPv1.2.pdf
オプション
■仕様
試験項目 | 内容 |
秤量 | DNA 抽出に使う検体量を秤量し、抽出を行います。 ( ※リアルタイムPCR 解析に使用する場合は必須) |
PCR 増幅確認 | 16S rDNA のユニバーサルプライマーを用いてPCR 増幅の有無を確認します。 |
二本鎖 (ds) DNA 濃度測定 | 蛍光法によりQubit またはマイクロプレートリーダーで測定します。 |
糞便 混錬作業 | 均一化のための糞便の混錬作業です。同一検体を複数の容器でお送りいただき、それらをまとめて秤量する場合、混錬作業が必要な場合があります。 |
■納品内容
報告納品内容 | 形式 |
秤量結果 | Excel ファイル |
PCR 増幅確認結果 | jpg ファイル |
二本鎖 (ds) DNA 濃度測定結果 | Excel ファイル |
■価格・納期
追加試験項目 | 検体数 | 単位 | 単価（税抜） | 目安納期 |
秤量 | 1 | 検体 | 1,000 円～ | ＋ 2 営業日～ |
PCR 増幅確認 | 1 | 検体 | 6,000 円 | ＋ 5 営業日～ |
二本鎖 (ds) DNA | 1 ～ 4 | 検体 | 5,000 円 | ＋ 2 営業日～ |
5 ～ 23 | 検体 | 3,000 円 | ||
24 ～ | 検体 | 2,000 円 | ||
糞便 混錬作業※ | 1 | 検体 | 1,000 円～ | お問い合わせ下さい |
ご依頼前の同意事項
・ DNA抽出物の納品には、別途送料が必要となる場合がございます。
・ 糞便検体でリアルタイムPCR解析、または糞便理化学分析を同時あるいは追加で行う場合は、保存液入りの糞便採取容器は使用できません。保存液なしの採取容器をご使用下さい。
・ 解凍に伴う梱包材の軟化や破断による汚染が考えられるため、発泡スチロールなどに梱包いただき、漏洩にご注意下さい。
・ 秤量および他試験項目を同時に行う場合には、検体の必要量が変わりますのでお問い合わせ下さい。
・ 本試験項目は、当社の受託解析サービス (アンプリコンシーケンス解析、リアルタイムPCR解析など)の基本サービスであり、当社の受託解析サービス以外での解析における必要なDNA量および品質を保証するものではありません。
・ 当社において、ショットガンメタゲノム解析での最適なDNA抽出方法の検証は行っておりません。
・ DNAの収量は、検体量および保存状態に依存します。あらかじめご了承下さい。
・ DNAの収量評価については、オプションサービスをご依頼下さい。
・ 糞便の場合、DNA必要量がお決まりの場合には事前にご相談下さい。
・ 哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。
・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。