きのこ同定試験

特 長

概 要

 きのこの同定には、従来の子実体の形態的特徴に基づく手法に加えて、DNA塩基配列 (rDNAのITS領域または28S rDNAのD1/D2領域) を使った解析がよく用いられます。当社では、お預かりした微生物株または子実体に対し、最適な領域を提案いたします。また、国際塩基配列データベース (DDBJ/ EMBL/GenBank) のデータを参照し、系統解析に必要となる帰属種・近縁種の標準株や標本などのDNA塩基配列データを取得し、「BioEdit」および「MEGA」を用いて分子系統解析から帰属種・近縁種を同定します。

 「DNA塩基配列解析」と「子実体の形態観察」を組合わせた試験セットとして、「きのこ形態観察付きDNA」も用意しております。遺伝子解析単独での試験よりも、精度の高い同定が期待できます。

受入可能な検体

種類必要量備考
平板培養物1枚当社での培養確認を行います。培養条件をご指示下さい。 生育性や純粋性に疑義がある場合には、連絡いたします。
液体培養物
スラント(斜面培養物)
1本
子実体お問い合わせ下さい。「きのこ形態観察付きDNA」をご希望の場合は、なるべく新鮮な子実体をお送り下さい。
直接DNA抽出することも可能です。詳しくはお問い合わせ下さい。

解析の流れ

(きのこITS rDNA+分子系統解析の場合)

納品内容

製品名報告内容付属データ
きのこITS rDNA(BLAST)
きのこ28S rDNA-D1/D2
(BLAST)
・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30 位・ DNA 塩基配列データ
・ シーケンス波形データ
きのこITS rDNA
   +分子系統解析
きのこ28S rDNA-D1/D2
   +分子系統解析
・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位
・ 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位
・ 分子系統解析に使用した配列一覧
・ 系統樹
・ 考察文章 (同定に至った経緯の文章説明)
+ 同定結果 + 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル
・系統樹ファイル
(PowerPoint)
・ DNA 塩基配列データ
・ シーケンス波形データ
きのこ形態観察付きDNA・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位
・ 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位
・ 分子系統解析に使用した配列一覧
・ 系統樹
子実体の形態観察
・ 総合考察 (同定に至った経緯の文章説明)
+ 同定結果 + 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル
・系統樹ファイル
(PowerPoint)
・ DNA 塩基配列データ
・ シーケンス波形データ
子実体観察像
※ 「きのこITS rDNA+分子系統解析」または「きのこ28S rDNA-D1/D2+分子系統解析」と形態観察のセットとなります。

価格・納期

試験項目検体数単位単価
(税抜)
目安納期
きのこITS rDNA(BLAST)
きのこ28S rDNA-D1/D2(BLAST)
1~8
37,000円
6営業日
9~お問い合わせ下さい
きのこITS rDNA+分子系統解析
きのこ28S rDNA-D1/D2+分子系統解析
1~8
72,000円
15営業日~
9~お問い合わせ下さい
きのこ形態観察付きDNA
96,000円
19営業日
中間報告:10営業日

※ 中間報告は、「相同性検索結果の上位5位」をEメール、またはFAXで報告いたします。報告書の結論と異なることがあります。
・ 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
・ DNA塩基配列データ、シーケンス波形データ、形態観察時の写真などは、報告時にお届けいたします。

ご依頼前同意事項

ご依頼前の同意事項(共通) およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。

・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。

ご依頼は、以下のファイルよりお申し込み下さい。

利用規約

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項(共通)
およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認しました。