きのこ 同定試験 (DNA塩基配列解析, Standard)
特 長
- 経験豊富な技術者による精度高い形態観察
- 分子系統解析まで実施（シーケンスのみを除く）
- 解析する遺伝子領域は当社スタッフによりご提案
- 遺伝子解析結果と形態観察の総合考察付きセットメニューもご用意
概 要
きのこの同定には、従来の子実体の形態的特徴に基づく手法に加えて、DNA 塩基配列（ITS rDNA 領域または28S rDNAD1/D2 領域）を使った解析がよく用いられます。当社では、お預かりした菌株に対し、最適な領域をご提案いたします。
また、国際塩基配列データベース（DDBJ/ EMBL/GenBank）のデータを参照し、帰属・近縁種の同定に必要な標準株や標本などのDNA 塩基配列データを取得し、「BioEdit」および「MEGA」を用いて分子系統解析から帰属・近縁種を同定します。
「DNA 塩基配列解析」と「子実体の形態観察」を組合わせた試験セットとして、Standard 試験も用意しております。遺伝子解析単独での試験よりも、精度の高い同定が期待できます。
受入可能な検体
| 種類 | 必要量 | 備考 |
|---|---|---|
| 平板培養物 | 1枚 | 当社での培養確認を行います。培養条件をご指示下さい。 コンタミネーションや純粋性に疑義がある場合には、連絡をいたします。 |
| 液体培養物 スラント（斜面培養物） | 1本 | |
| 子実体 | お問い合わせ下さい。 | きのこStandard をご希望の場合は、なるべく新鮮な子実体をお送り下さい。 直接DNA 抽出することも可能です。詳しくはお問い合わせ下さい。 |
解析の流れ
例）きのこ ITS-rDNA
- 培養・純度確認
- DNA抽出
- PCR増幅
- シーケンス
- 配列決定
- 相同性検索
- 文献調査
- データセット構築
- 分子系統解析
納品内容
| 製品名 | 報告内容 | 付属データ |
|---|---|---|
| きのこITS rDNA（BLAST） きのこ28S rDNA-D1/D2 （BLAST） | ・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30 位 | ・ DNA 塩基配列データ ・ シーケンス波形データ |
| きのこITS rDNA きのこ28S rDNA-D1/D2 | ・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30 位 ・ 当社微生物同定データベース照合結果の上位30 位 ・ 系統樹 ・ 同定結果 ＋ 近縁種のバイオセーフティレベル | ・系統樹ファイル （PowerPoint） ・ DNA 塩基配列データ ・ シーケンス波形データ |
| きのこStandard | ・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30 位 ・ 当社微生物同定データベース照合結果の上位30 位 ・ 系統樹 ・ 考察文章（同定に至った経緯の文章説明） ・ ＋ 同定結果 ＋ 近縁種のバイオセーフティレベル | ・系統樹ファイル （PowerPoint） ・ DNA 塩基配列データ ・ シーケンス波形データ ・ 子実体観察像 |
価格・納期
| 製品名 | 検体数 | 単位 | 単価 （税抜） | 中間報告 | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|---|
| きのこITS rDNA（BLAST） きのこ28S rDNA-D1/D2（BLAST） | 1～8 | 株 | 37,000円 | ー | 6営業日 |
| 9～ | 株 | お問い合わせ下さい | |||
| きのこITS rDNA＋分子系統解析 きのこ28S rDNA-D1/D2＋分子系統解析 | 1～8 | 株 | 73,000円 | ー | 15営業日～ |
| 9～ | 株 | お問い合わせ下さい | |||
| きのこStandard | 1 | 株 | 93,000円 | 10 営業日 | 19 営業日 |
・ 多検体で依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
・ DNA 塩基配列データ、シーケンス波形データおよび報告書中の写真などは、報告時にお届けいたします。
ご依頼前の同意事項
ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。
・ ご依頼前の同意事項（共通）を必ずご確認下さい
ご依頼は、以下のファイルよりお申し込み下さい。