きのこ 同定試験 (DNA塩基配列解析, Standard)

特 長

  • 経験豊富な技術者による精度高い形態観察
  • 分子系統解析まで実施(シーケンスのみを除く)
  • 解析する遺伝子領域は当社スタッフによりご提案
  • 遺伝子解析結果と形態観察の総合考察付きセットメニューもご用意

概 要

きのこの同定には、従来の子実体の形態的特徴に基づく手法に加えて、DNA 塩基配列(ITS rDNA 領域または28S rDNAD1/D2 領域)を使った解析がよく用いられます。当社では、お預かりした菌株に対し、最適な領域をご提案いたします。
また、国際塩基配列データベース(DDBJ/ EMBL/GenBank)のデータを参照し、帰属・近縁種の同定に必要な標準株や標本などのDNA 塩基配列データを取得し、「BioEdit」および「MEGA」を用いて分子系統解析から帰属・近縁種を同定します。
「DNA 塩基配列解析」と「子実体の形態観察」を組合わせた試験セットとして、Standard 試験も用意しております。遺伝子解析単独での試験よりも、精度の高い同定が期待できます。

受入可能な検体

種類必要量備考
平板培養物1枚当社での培養確認を行います。培養条件をご指示下さい。 コンタミネーションや純粋性に疑義がある場合には、連絡をいたします。
液体培養物
スラント(斜面培養物)
1本
子実体お問い合わせ下さい。きのこStandard をご希望の場合は、なるべく新鮮な子実体をお送り下さい。 直接DNA 抽出することも可能です。詳しくはお問い合わせ下さい。

解析の流れ

例)きのこ ITS-rDNA

  • 培養・純度確認
  • DNA抽出
  • PCR増幅
  • シーケンス
  • 配列決定
  • 相同性検索
  • 文献調査
  • データセット構築
  • 分子系統解析

納品内容

製品名報告内容付属データ
きのこITS rDNA(BLAST)
きのこ28S rDNA-D1/D2 (BLAST)
・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30 位・ DNA 塩基配列データ
・ シーケンス波形データ
きのこITS rDNA
きのこ28S rDNA-D1/D2
・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30 位
・ 当社微生物同定データベース照合結果の上位30 位
・ 系統樹
・ 同定結果 + 近縁種のバイオセーフティレベル
・系統樹ファイル
(PowerPoint)
・ DNA 塩基配列データ
・ シーケンス波形データ
きのこStandard・ 国際塩基配列データベース照合結果の上位30 位
・ 当社微生物同定データベース照合結果の上位30 位
・ 系統樹
・ 考察文章(同定に至った経緯の文章説明)
・ + 同定結果 + 近縁種のバイオセーフティレベル
・系統樹ファイル
(PowerPoint)
・ DNA 塩基配列データ
・ シーケンス波形データ
・ 子実体観察像

価格・納期

製品名検体数単位単価
(税抜)
中間報告目安納期
きのこITS rDNA(BLAST)
きのこ28S rDNA-D1/D2(BLAST)
1~837,000円6営業日
9~お問い合わせ下さい
きのこITS rDNA+分子系統解析
きのこ28S rDNA-D1/D2+分子系統解析
1~873,000円15営業日~
9~お問い合わせ下さい
きのこStandard193,000円10 営業日19 営業日

・ 多検体で依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
・ DNA 塩基配列データ、シーケンス波形データおよび報告書中の写真などは、報告時にお届けいたします。

ご依頼前同意事項

ご依頼前の同意事項(共通) およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。

・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい

ご依頼は、以下のファイルよりお申し込み下さい。