生体関連 特異プライマーPCR 解析(定性)

特 長

  • 当社所有のプライマーセットを用いて目的塩基長のバンドが出現することを確認する定性試験
  • 様々な検体に対応

概 要

検体中に含まれる特定分類群や特定機能遺伝子をターゲットにしたプライマーセット(リアルタイムPCR解析ページ参照)を用いて、PCR増幅、電気泳動を行います。

受入可能な検体

  • 生体由来検体A区分:糞便検体
  • 生体由来検体B区分:唾液などA区分以外
  • その他

由来検体の種類
ヒトヒト糞便
実験動物類マウス、ラット等の動物糞便、腸管内容物
家畜類ブタ、ウシ、ウマ等の動物糞便
家禽類ニワトリ等の家禽糞便、腸管内容物
ペット類イヌ、ネコ等のペット糞便
その他魚類、昆虫等の糞便、腸管内容物

由来検体の種類
ヒト
(その他動物種はご相談ください)
唾液、プラーク
皮膚拭取物
膣内拭取物

由来検体の種類
DNA抽出物PCR増幅が確認されたDNA抽出物

PCR増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

必要検体量・送付方法

検体の種類必要量留意点および送付方法
A区分糞便、腸管内容物、 ルーメン液 採便容器(保存液なし) もしくは気密性の高い容器 0.2~0.5g採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送
採便容器(保存液あり)採取後速やかに冷蔵保存 冷蔵輸送推奨、常温輸送可
B区分A区分以外
(口腔内容物(唾液、プラーク)、
皮膚拭取物など)
スワブ メタフロキーパー(皮膚) 1.5mLチューブなど 0.2~1mL
(唾液)
唾液、舌苔、口腔粘膜、プラークを採取し、 速やかに冷凍保存、冷凍輸送
綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液(PBS、生理食塩水、滅菌水など)に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送
血液、臓器、細胞組織の受け入れはお断りいたします。
DNA抽出物濃度:10ng/µL
容量:30μL(1プライマーあたり15µL以上)
抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送

糞便検体の返送

糞便検体の返送をご希望のお客様には、定温マルチBOXによる臨床検体輸送サービスを利用してお送りいたします。

項目容器サイズ(内寸)単位価格
糞便検体返送(冷凍)最大:500mm×500mm×450mm1個43,000円~

作業の流れ

  • DNA抽出
  • DNA精製
  • PCR増幅
  • 電気泳動
  • 判定

仕 様

指定いただいたプライマーを用いてPCR増幅します。アガロースゲル電気泳動により特異プライマーPCR増幅産物の有無を確認し、PCR産物を電気泳動することで出現したバンドパターンの画像を報告いたします。

納品内容・報告書サンプル

報告内容形式
電気泳動像jpgファイル

解析可能な対象分類群および遺伝子

  • 全菌数
  • アーキア
  • 腸内細菌
  • 口腔内細菌
  • 皮膚常在菌
  • 食品

対象菌種(分類群)遺伝子備考
全真正細菌16S検体中に含まれる全真正細菌
全アーキア16S検体中に含まれる全アーキア
全菌類 ITSITS領域検体中に含まれる全菌類

対象菌種(分類群)遺伝子備考
Methanobacteriaceae 科-ヒト腸内アーキアであるMethanobacteriaceae 科(Methanobrevibacter およびMethanosphaera)

対象菌種(分類群)遺伝子備考
Akkermansia muciniphila16S腸管内のムチン分解菌であるA. muciniphila
Bacteroidetes門16Sヒト・動物腸管内の優勢菌であるBacteroidetes門
Bacteroidales目16Sヒト・動物腸管内の優勢菌であるBacteroidales目 (Bacteroides/Prevotella/Porphyromonas属など)
Bacteroides属-ヒト・動物腸管内の優勢菌であるBacteroides属
Bacteroides Detection Kit (Cat. No. RI-0011) 使用
Bacteroides fragilis-ヒト・動物腸管内および口腔内B. fragilis
Bacteroides fragilis Detection Kit (Cat. No. RO-0003) 使用
Bifidobacterium属16Sヒト腸管内の優勢乳酸菌であるBifidobacterium属
Bifidobacterium longum16S食品中あるいは腸管内のB. longum
Bifidobacterium longum subsp. longumtuf食品中あるいは腸管内のB. longum subsp. longum
Bifidobacterium pseudocatenulatumgroEL腸管内のB. pseudocatenulatum
Bilophila wadsworthia-胆汁により発育が促進され,β-ラクタム薬に高度耐性をもつB. wadsworthia
Bilophila wadsworthia Detection Kit (Cat. No. RI-0009) 使用
Blautia属-ヒト腸管内の最優勢菌種であるBlautia属
Blautia Detection Kit (Cat. No. RI-0008) 使用
Candidate Division TM716S炎症性腸疾患との関わりが注目されているCandidate Division TM7
Clostridium cluster I & II16Sヒト・動物腸管内の優勢菌種であり狭義のClostridium属菌であるClostridium cluster I およびII
Clostridium cluster IV-ヒト・動物腸管内の優勢菌種であるClostridium cluster IV
Clostridium cluster XI16Sヒト・動物腸管内の優勢菌種であり狭義のClostridium属菌である
Clostridium cluster XI
Clostridium cluster XIV16Sヒト・動物腸管内の優勢菌種であるClostridium cluster XIV
Clostridium cluster XV-ヒト・動物腸管内のClostridium cluster XV
Clostridium cluster XV Detection Kit (Cat. No. RI-0002) 使用
Clostridium cluster XVI〜XVIII-ヒト・動物腸管内のClostridium cluster XVI、XVIIおよびXVIII
Clostridium cluster XVI・XVII・XVIII Detection Kit (Cat. No. RI-0006) 使用
Clostridium cluster XVIII-ヒト・動物腸管内のClostridium cluster XVIII
Clostridium cluster XVIII Detection Kit (Cat. No. RI-0003) 使用
Clostridium perfringens (ウェルシュ菌)16S日和見感染菌であるC. perfringens (ウェルシュ菌)
Clostridium butyricum-酪酸を生成する偏性嫌気性芽胞形成グラム陽性桿菌
Clostridium butyricum Detection Kit (Cat. No. RI-0004) 使用
Clostridium difficile16S偽膜性腸炎、抗菌薬関連下痢症に関与するClostridium difficile
Clostridium leptum-ヒト・動物腸管内のC. leptum
Clostridium leptum Detection Kit (Cat. No. RI-0007) 使用
Clostridium hiranonisおよびC. scindensbaiCD7α-dehydroxylase活性を有するC. hiranonisおよびC. scindens
Clostridium hylemonaeおよびC. scindensbaiJ7α-dehydroxylase活性を有するC. hylemonaeおよびC. scindens
Coriobacteriaceae科16Sヒト腸内細菌の優勢菌であるCoriobacteriaceae科(Atopobium/Collinsella/Eggerthella属)
Enterobacteriaceae科16Sヒト・動物腸管内常在菌である腸内細菌科 (E.coli, Shigella etc.)
Enterococcus属16Sヒト・動物腸管内および環境中のEnterococcus属
Enterococcus faecalis-食品中あるいは環境中のE. faecalis
Enterococcus faecalis Detection Kit (Cat. No. RF-0003) 使用
Escherichia coli / Shigella16Sヒト・動物腸管内および環境中の大腸菌 (E.coliおよびShigella)
Faecalibacterium prausnitzii16Sヒト腸管内の優勢菌種であるF. prausnitziiおよびその近縁菌種
Firmicutes門16Sヒト・動物腸管内の優勢菌であるFirmicutes門
Fusobacteria門16S臨床細菌学的に重要なヒト・動物腸管内および口腔内Fusobacterium門
Fusobacterium属-臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内Fusobacterium属
Fusobacterium Detection Kit (Cat. No. RO-0005) 使用
Fusobacterium varium-ヒト・動物腸管内のF. varium
Fusobacterium varium Detection Kit (Cat. No. RI-0005) 使用
Fusobacterium nucleatum16S臨床細菌学的に重要なF. nucleatum
Helicobacter属16Sヒト胃腸間内の常在菌であるHelicobacter属
Klebsiella pneumoniae-ヒト・動物腸管内および口腔内 K. pneumoniae
Klebsiella pneumoniae Detection Kit (Cat. No. RI-0014) 使用
Lactobacillus属16Sヒト・動物腸管内のLactobacillus/Pediococcus/Weissella属
Lactobacillus gasseri-ヒト・動物腸管内のL. gasseri
Lactobacillus gasseri Detection Kit (Cat. No. RI-0010) 使用
Parabacteroides属-ヒト・動物腸管内の優勢菌であるParabacteroides属
Parabacteroides Detection Kit (Cat. No. RI-0013) 使用
Prevotella属-ヒト・動物腸管内および口腔内Prevotella属
Prevotella Detection Kit (Cat. No. RO-0004) 使用
Proteus属16Sヒト・動物腸管内および環境中のProteus属
Proteus mirabilisureA尿路感染症に関連するP. mirabilis
Pseudomonas属16Sヒト・動物腸管内および環境中のPseudomonas属
Pseudomonas aeruginosagyrBヒト・動物腸管内および環境中に存在し、緑膿菌感染症の原因となるP. aeruginosa
Roseburia/ Eubacteriuim rectele group16Sヒト・動物腸管内のRoseburia/ Eubacteriuim属
Salmonella属invAヒトや動物の消化管に生息し、一部がヒトや動物に感染して病原性を示すSalmonella属
Staphylococcus属16Sヒト・動物腸管内および環境中のStaphylococcus属
Staphylococcus aureus-臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内S. aureus
Staphylococcus aureus Detection Kit (Cat. No. RO-0009) 使用
Streptococcus属-ヒト・動物腸管内・口腔内のStreptococcus属
Streptococcus Detection Kit (Cat. No. RO-0001) 使用
Streptococcus bovis16Sルーメン細菌であるS. bovis (S. equinus)
Sutterella属- 胆汁耐性菌であり、Autism-associated bacteria として議論されているSutterella属
Sutterella Detection Kit (Cat. No. RI-0012) 使用
Veillonella属-ヒト・動物腸管内および口腔内常在菌であるVeillonella属
Veillonella Detection Kit (Cat. No. RO-0007) 使用
Roseburia属 NEW16Sヒト腸管内の酪酸産生菌であるRoseburia属 (R. inulinivorans除く)
Anaerostipes属 NEW-ヒト腸管内の優勢菌種であるAnaerostipes属 (Anaerostipes Detection Kit (Cat. No. RI-0017) 使用)
Fusicatenibacter saccharivorans NEW-ヒト腸管内の優勢菌種であるF. saccharivorans (Fusicatenibacter saccharivorans Detection Kit (Cat. No. RI-0020) 使用)
Christensenella minuta NEW-痩せ型のヒトに多いとされるC. minuta (Christensenella minuta Detection Kit (Cat. No. RI-0015) 使用)
Peptostreptococcus stomatis NEW-大腸がん病巣から高頻度に検出されるP. stomatis (Peptostreptococcus stomatis Detection Kit (Cat. No. RI-0018) 使用)
Lactobacillus fermentum NEW16Sヒト・動物腸管内のL. fermentum
Lactobacillus casei group NEW16Sヒト・動物腸管内のL. casei, L. paracasei, L. rhamnosusおよびL. zeae
Lactobacillus casei NEW16Sヒト・動物腸管内のL. casei
Lactobacillus mucosae NEW-ヒト・動物腸管内のL. mucosae (Lactobacillus mucosae Detection Kit (Cat. No. RI-0019) 使用)
Enterococcus faecium NEWrecAヒト・動物腸管内および環境中のE. faecium
Bifidobacterium bifidum NEW16Sヒト小児腸管内の優勢菌であるB. bifidum
Bifidobacterium breve NEW16Sヒト小児腸管内の優勢菌であるB. breve
Eggerthella属 NEW-ヒト腸管内のEggerthella属 (Eggerthella Detection Kit (Cat. No. RI-0021) 使用)
Cetobacterium属 NEW-ヒト腸管内Fusobacteria門細菌であるCetobacterium属 (Cetobacterium Detection Kit (Cat. No. RI-0016) 使用)
Verrucomicrobia門 NEW16Sヒト・動物腸管内のVerrucomicrobia門
Methanobacteriaceae科 NEW-ヒト腸内アーキアであるMethanobacteriaceae科 (MethanobrevibacterおよびMethanosphaera)(Methanobacteriaceae Detection Kit (Cat. No. RI-0017) 使用)
Atopobium parvulum NEW16S大腸がんとの関連が疑われているAtopobium parvulum

対象菌種(分類群)遺伝子備考
Actinomyces属-ヒト・動物腸管内および口腔内常在菌であるActinomyces属
Actinomyces Detection Kit (Cat. No. RO-0008) 使用
Aggregatibacter actinomycetemcomitans-歯周病の原因菌として注目されているA. actinomycetemcomitans
Aggregatibacter actinomycetemcomitans Detection Kit (Cat. No. RO-0011) 使用
Bacteroides fragilis-ヒト・動物腸管内および口腔内B. fragilis
Bacteroides fragilis Detection Kit (Cat. No. RO-0003) 使用
Campylobacter属-臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内Campylobacter属
Campylobacter Detection Kit (Cat. No. RO-0006) 使用
Candidate Division TM716S歯周炎との関わりが注目されているCandidate Division TM7
Fusobacterium属-臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内Fusobacterium属
Fusobacterium Detection Kit (Cat. No. RO-0005) 使用
Fusobacterium nucleatum16S歯周病の原因菌として注目されているF. nucleatum
Leptotrichia属-口腔内常在菌であるLeptotrichia属
Leptotrichia Detection Kit (Cat. No. RO-0012) 使用
Prevotella属-ヒト・動物腸管内および口腔内Prevotella属
Prevotella Detection Kit (Cat. No. RO-0004) 使用)
Porphyromonas gingivalis-ヒトの歯肉溝に生息し、歯周病の原因菌として注目されている
P. gingivalis Porphyromonas gingivalis Detection Kit (Cat. No. RO-0010) 使用
Streptococcus mutans-う蝕に関与するS. mutans
Streptococcus mutans Detection Kit (Cat. No. RO-0002) 使用
Streptococcus intermedius-ヒト口腔内常在菌であるS. intermedius
Streptococcus intermedius Detection Kit (Cat. No. RO-0015) 使用
Staphylococcus aureus-臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内S. aureus
Staphylococcus aureus Detection Kit (Cat. No. RO-0009) 使用
Treponema denticola-歯周病の原因菌として注目されているT. denticola
Treponema denticola Detection Kit (Cat. No. RO-0013) 使用
Tannerella forsythia16S歯周病の原因菌として注目されているT. forsythia
(Tannerella forsythia Detection Kit (Cat. No. RO-0014)
Veillonella属-ヒト・動物腸管内および口腔内常在菌であるVeillonella属
Veillonella Detection Kit (Cat. No. RO-0007) 使用

対象菌種(分類群)遺伝子備考
Acinetobacter属16Sヒト腸内・皮膚の常在菌であるAcinetobacter属
Chryseobacterium属16Sヒト腸内・皮膚の常在菌であるChryseobacterium属
Cutibacterium acnesgrpE皮膚の常在菌であるP. acnes
Staphylococcus epidermidisgmk表皮ブドウ球菌であるS. epidermidis
Staphylococcus warnerisodA皮膚の常在菌であるS. warneri

対象菌種(分類群)遺伝子備考
Alicyclobacillus属-耐熱性好酸性菌であるAlicyclobacillus属
Bacillus coagulans16S食品中あるいは環境中のB. coagulans
Bacillus subtilis subsp. subtilis-食品中あるいは環境中のB. subtilis subsp. subtilis
Bifidobacterium animalis subsp. lactis16S-23S食品中あるいは環境中のB. animalis subsp. lactis
Bifidobacterium longum16S食品中あるいは環境中のB. longum
Enterococcus faecalis-食品中あるいは環境中のE. faecalis
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus-食品中のL. delbrueckii subsp. bulgaricus
Lactobacillus brevis-食品中のL. brevis
Lactobacillus rhamnosus16S食品中あるいは環境中のL. rhamnosus
Lactobacillus helveticus-食品中のL. helveticus
Lactobacillus paraplantarum-食品中のL. paraplantarum
Lactobacillus plantarumrecA食品中あるいは環境中のL. plantarum
Lactococcus lactisgapB食品中あるいは環境中のL. lactis
Lactococcus lactis subsp. lactis group-食品中あるいは環境中のL. lactis subsp. lactisおよび subsp. hordniae
Lactococcus lactis subsp. cremoris group-食品中あるいは環境中のL. actis subsp. cremorisおよび subsp. tructae
Listeria属prsA食品中あるいは環境中のListeria属
Listeria monocytogeneshlyA食品中あるいは環境中のL. monocytogenes
Pediococcus pentosaceusrecA食品中あるいは環境中のP. pentosaceus
Tetragenococcus halophilus16S食品中あるいは環境中のT. halophilus
Saccharomyces cerevisiaenmd3食品中あるいは環境中のS. cerevisiae
Streptococcus thermophilus-食品中のS. thermophilus
芽胞菌spo0A食品中あるいは環境中の芽胞菌 (Bacillus属/Geobacillus属/Anoxybacillus 属etc)
酢酸菌-Acetobacter属/Acidomonas属/Gluconacetobacter属/Gluconobacter属/Kozakia属/Tanticharoenia属

ご指定いただいたプライマーを用いて増幅したPCR 産物を、電気泳動することで出現したバンドパターンの画像を報告いたします。

価格・納期

製品名検体数単位単価
(税抜)
納期
特異プライマーPCR解析(定性)検体数1、ターゲット1の場合検体25,000円14営業日~
検体数2、ターゲット2の場合検体19,000円
検体数2、ターゲット3の場合検体20,000円
検体数5、ターゲット5の場合検体14,000円

依頼書の入手と同意事項の確認

ご依頼前の同意事項(共通) およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。

・ 新たにプライマーを合成する場合、合成費用が必要となります。
・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。

ご依頼は、以下のファイルをダウンロード頂きお申し込み下さい。

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