環境 特異プライマーPCR解析 (定性)

特長

  • 当社のオリジナルを含む多数のプライマーセットを保有

  • 食品関連や環境関連の微生物を対象

  • 様々な検体に対応

概要

検体中に含まれる特定の帰属分類群や特定機能遺伝子をターゲットにしたプライマーセットを用いて、PCR増幅、電気泳動を行い、目的塩基長のバンドが出現することを確認して定性を行う試験です。

受入可能な検体

検体区分

検体

検体の種類

対象

環境検体

食品

発酵食品、乳酸菌飲料など

細菌、アーキア、カビ・酵母のDNA

活性汚泥

発酵槽の汚泥、下水汚泥など

土壌

一般土壌、砂、火山灰など

発酵検体

堆肥、コンポスト、培養液など

環境水

水道水、工業廃水、海水、湖沼水など

DNA抽出物

PCR 増幅が確認されたDNA 抽出物

PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

必要検体量・送付方法

検体

必要量

留意点および送付方法

食品

10gまたは100 mL

食品の保存温度で保存、輸送

活性汚泥

5~10mL

採取後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送

土壌

1~5g

発酵検体

堆肥、コンポストなど

1~ 5g

培養液など

5~10mL

環境水

水道水、濁りの少ない河川水など

100~1000mL

工業廃水、下水など

50~500 mL

DNA 抽出物

濃度  10ng/μL
総量 30μL 以上
(1 プライマー追加ごとに+ 15 μL 以上)

抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送

  • 外洋海水、新戒堆積物などの生物量が少ないと考えられる検体についてはお問い合わせ下さい。

作業の流れ

  • DNA抽出

  • DNA精製

  • PCR増幅

  • 電気泳動

  • 判定

仕様

ご指定いただいたプライマーを用いてPCR増幅します。特異プライマーPCR増幅産物の有無をアガロースゲル電気泳動により確認し、電気泳動後のゲル画像を報告します。

当社保有プライマー

全菌数

全真正細菌、全アーキア、カビ・酵母 ITS [詳細はこちら]

環境アーキア

メタン菌、Methanobacteriaceae科、Methanoculleus属、Methanolobus属、Methanomethylovorans属、
Methanosarcina属、 Methanospirillum属 [詳細はこちら]

環境水 ( 海水・ 地下水など)

Aeromonas 属、Vibrio 属、Vibrio vulnificusVibrio parahaemolyticusLegionella 属、Legionella pneumophila
Serratia marcescens [詳細はこちら]

バイオ浄化

Dehalobacter 属、Dehalococcoides 属 [詳細はこちら]

バイオリーチング

Acidithiobacillus thiooxidansSulfobacillus 属 [詳細はこちら]

窒素循環 ( 硝化/脱窒)

Gardnerella vaginalis [詳細はこちら]

微生物腐食

アンモニア酸化細菌、アンモニア酸化アーキア、Anammox細菌、亜硝酸還元菌、窒素固定細菌、亜酸化窒素還元菌、
亜硝酸酸化細菌(Nitrobacter 属)、亜硝酸酸化細菌(Nitrospira 属)、Pseudomonas aeruginosa [詳細はこちら]

食品

酢酸菌、Alicyclobacillus 属、Bacillus subtilisLevilactobacillus brevisLactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus
Lactiplantibacillus paraplantarumLactiplantibacillus plantarumStreptococcus thermophilus [詳細はこちら]

その他

メタン酸化細菌、水素産生菌、Candidate Division TM7、Thiothrix属、Alphaproteobacteria綱 [詳細はこちら]

価格・納期

試験項目

内容(解析例)

単位

単価(税抜)

目安納期

特異プライマーPCR 解析 ( 定性 )

検体数 1

1 プライマーの場合

検体

36,000 円

15 営業日~

検体数 2

2 プライマーの場合

34,000 円

検体数 2

3 プライマーの場合

38,000 円

検体数 5

5 プライマーの場合

39,000 円

<オプション> プライマー設計

-

45,000 円

+ 10 営業日

ご依頼前の同意事項

・ 新たにプライマーを合成する場合、合成費用が必要となります。
・ 陽性対象 (ポジティブコントロール) をあわせて実施する場合にはお問い合わせ下さい。
・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。