環境 DNA抽出

特長

  • 環境検体からDNAを抽出し納品

概要

様々な種類の環境検体からDNAを抽出します。

受入可能な検体

由来

検体の種類

食品

発酵食品、 乳酸菌飲料など

活性汚泥

発酵槽の汚泥、 下水汚泥など

土壌

一般土壌、 火山灰など

発酵検体

堆肥、 コンポスト、 培養液など

環境水

海水、 湖沼水など

必要検体量・送付方法

検体の種類

必要量

留意点および送付方法

食品

10 g または 100 mL

食品の保存温度で保存、 輸送

活性汚泥

5 ~ 10 mL

採取後速やかに冷蔵保存、 冷蔵輸送

土壌
堆肥
コンポスト

1 ~ 5 g

環境水

水道水、 濁りの少ない河川水など

100 ~ 1000 mL

工業廃水、 下水など

50 ~ 500 mL

培養液

5 ~ 10 mL

※ 外洋海水、深海堆積物など、生物量が少ないと考えられる検体についてはお問い合わせ下さい。

作業の流れ

  • 検体の秤量(オプション)

  • 破砕

  • 精製

  • 濃度測定

仕様

抽出キット例※

内容

・ MORA-EXTRACT

抽出~精製を左記キットで実施します。

・ ISOIL for Beads Beating
・ DNeasy PowerClean Pro Cleanup Kit

※ 検体の種類によって、試薬、キットを変更します。他のDNA抽出キットを使用したDNA抽出をご希望の場合、お問い合わせ下さい。

納品内容

滅菌水あるいはTEバッファーに溶解したDNAを、70 µL以上納品します。吸光度測定によるDNA濃度測定結果を報告します。

報告納品内容

形式

DNA 抽出物

マイクロチューブ

DNA 濃度測定結果

Excel ファイル

報告書サンプル

SAMPLE/16S rDNA-500 (BLAST) 報告書v1.12のサムネイル

価格納期

試験項目

区分

検体数

単位

単価(税抜)

目安納期

DNA 抽出

A 区分

1

検体

12,000 円

15 営業日~

オプション

仕様

試験項目

内容

秤量

DNA 抽出に使う検体量を秤量し、 抽出を行います。
( ※ リアルタイム PCR 解析に使用する場合は必須 )

PCR 増幅確認

16S rDNA のユニバーサルプライマーを用いて PCR 増幅の有無を確認します。

二本鎖 (ds) DNA 濃度測定

蛍光法により Qubit またはマイクロプレートリーダーで測定します。

濃度調整

TE バッファーで指定の濃度に希釈調整します。
( ※ DNA 抽出物が指定の濃度未満の場合、 調整できません)

納品内容

報告納品内容

形式

秤量結果

Excel ファイル

PCR 増幅確認結果

jpg ファイル

二本鎖 (ds) DNA 濃度測定結果

Excel ファイル

濃度希釈結果

Excel ファイル

価格・納期

追加試験項目

検体数

単位

単価(税抜)

目安納期

秤量

1

検体

1,000 円~

+ 2 営業日~

PCR 増幅確認

1

検体

6,000 円

+ 5 営業日~

二本鎖 (ds) DNA
濃度測定 ( 蛍光法 )

1 ~ 4

検体

6,000 円

+ 2 営業日~

5 ~ 23

検体

3,000 円

24 ~

検体

2,000 円

濃度調整

1

検体

1,000 円

+ 5 営業日~

ご依頼前の同意事項

・ DNA抽出物の納品には、別途送料 (クール便) が必要となります。
・ 水滴などに伴う梱包材の軟化や破断による汚染等が考えられるため検体は、発泡スチロール容器などに梱包いただき、漏洩にご注意下さい。
・ 秤量および他分析項目を同時に行う場合には、検体の必要量が変わりますのでお問い合わせ下さい。
・ 本サービスは、当社の受託解析サービス (アンプリコンシーケンス解析、リアルタイムPCR解析など) の基本サービスであり、当社の受託解析サービス以外での解析における必要なDNA量および品質を保証するものではありません。
・ 当社において、ショットガンメタゲノム解析での最適なDNA抽出方法の検証は行っておりません。
・ DNAの収量は、検体の採取量および保存状態に依存します。あらかじめご了承下さい。
・ DNAの収量の評価については、オプションサービスをご依頼下さい。
・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。