recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarumグループ）
特長
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16S rDNAで種の識別が困難なLactiplantibacillus plantarumグループの同定に有効
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近隣結合法 (NJ法) 、最節約法 (MP法) 、最尤法 (ML法) から選択可能
概要
Lactiplantibacillus plantarumグループに含まれる菌種間では16S rDNA 塩基配列の差異が小さく、特にL. plantarumとL. pentosusの識別は非常に困難です。しかし、機能遺伝子であるrecA 遺伝子を解析することによりL. plantarumとL. pentosus の識別が可能です。
受入可能な検体
種類 | 必要量 | 備考 |
平板培養物 | 1 枚 | 当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。 |
液体培養物 スラント ( 斜面培養物 ) アンプル・凍結保存品 ( グリセロールストック) | 1 本 |
解析の流れ
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純度確認
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DNA抽出
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PCR増幅
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シーケンス
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塩基配列決定
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分子系統解析
納品内容
試験項目 | 報告内容 | 付属データ |
recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarum） | ・国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 | ・ 分子系統樹ファイル |
価格・納期
試験項目 | 単位 | 単価（税抜） | 目安納期 |
recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarum） | 式 | 64,000 円 | 15営業日～ |
ご依頼前の同意事項
・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
・ PCR時のポリメラーゼ反応エラーおよびシーケンサーのシグナル強度に起因する混合塩基の判定、ばらつきにおける試験結果への影響は考慮しておりません。
・ 検体の状態によりPCR増幅ができないことがあります。PCRを2回実施しても増幅産物が得られない場合、以降の試験を中止とします。PCR条件を変更しての再試験実施を希望される場合、追加費用が発生します。
・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベルを示すものではありません。