試験のポイント
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当社のオリジナルを含む多数のプライマーセットを保有
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腸内細菌、口腔内細菌、皮膚常在菌などの微生物を対象
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様々な検体に対応
サービス概要
- 試験項目
- 特異プライマーPCR 解析（定性）
- 受入可能な検体
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◎生体由来検体（糞便、腸管内容物、ルーメン液、唾液、プラーク、皮膚拭取物、膣内拭取物など）
◎DNA抽出物 - 目安納期
- 15 営業日～
- オプション
- プライマー設計
検体中に含まれる特定の帰属分類群や特定機能遺伝子をターゲットにしたプライマーセットを用いて、PCR増幅、電気泳動を行い、目的塩基長のバンドが出現することを確認して定性を行う試験です。
受入可能な検体
- 血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
- 哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。
- DNA抽出物の場合、PCR増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。
| 検体区分 | 由来 | 検体の種類 | 対象 |
|---|---|---|---|
| A 区分： 糞便検体 | ヒト | 糞便 | 細菌・アーキア、カビ・酵母のDNA |
| マウス、ラットなどの実験動物類 | 糞便、腸管内容物 | ||
| ブタ、ウシ、ウマなどの家畜類 | 糞便、腸管内容物、ルーメン液 | ||
| ニワトリなどの家禽類 | 糞便、腸管内容物 | ||
| イヌ、ネコなどのペット類 | 糞便 | ||
| 魚類、昆虫、その他 | 糞便、腸管内容物 | ||
| B 区分： その他生体由来検体 | ヒト （その他動物種はご相談下さい） | 唾液、プラーク | |
| 皮膚拭取物 | |||
| 膣内拭取物 | |||
| DNA抽出物 | ー | PCR 増幅が確認されたDNA抽出物 |
必要検体量・送付方法
| 区分 | 検体の種類 | 容器種類 | 必要量 | 留意点および送付方法 |
|---|---|---|---|---|
| A 区分： 糞便検体 | 糞便、 腸管内容物、ルーメン液 | 気密性の高い容器 | 0.2 ～ 0.5 g | 採取後速やかに冷凍保存、 冷凍輸送 |
| 糞便採取容器（保存液あり） | 0.2 ～ 0.5 g | 採取後速やかに冷蔵保存 冷蔵輸送推奨、 常温輸送可 | ||
| メタボロキーパー®※1 | ||||
| B 区分： その他生体由来検体 | A 区分以外 ・口腔内容物 (唾液、プラーク ) ・皮膚拭取物など | スワブ 1.5 mL チューブなど | 0.2 ～ 1 mL （唾液） | 唾液、舌苔、口腔粘膜、プラークを採取し、速やかに冷凍保存、冷凍輸送 |
| 綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液（PBS、生理食塩水、滅菌水など）に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送 | ||||
| メタフロキーパー※1（皮膚、唾液） | 0.2 ～ 1 mL （唾液） | 採取後速やかに冷蔵保存 冷蔵輸送推奨、常温輸送可 | ||
| DNA抽出物※2 | 濃度 10 ng/µL 総量 30 µL 以上 （1 領域を追加ごとに＋15 µL 以上） | 抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送 | ||
- 保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。
- PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。
解析プロセス
- DNA抽出
- DNA精製
- PCR増幅
- 電気泳動
- 判定
仕様
ご指定いただいたプライマーを用いてPCR増幅します。特異プライマーPCR増幅産物の有無をアガロースゲル電気泳動により確認し、電気泳動後のゲル画像を報告します。
価格・納期
| 試験項目 | 内容（解析例） | 単位 | 単価 （税抜） | 目安納期 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 特異プライマーPCR 解析 （定性） | 検体数 1 | 1 プライマーの場合 | 検体 | 36,000 円 | 15 営業日～ |
| 検体数 2 | 2 プライマーの場合 | 34,000 円 | |||
| 検体数 2 | 3 プライマーの場合 | 38,000 円 | |||
| 検体数 5 | 5 プライマーの場合 | 39,000 円 | |||
| 〈オプション〉 プライマー設計 | ー | 式 | 45,000 円 | ＋ 10 営業日 | |
当社保有プライマー
〈全菌数〉
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| 全真正細菌 | 16S | 検体中に含まれる全真正細菌 |
| 全アーキア | 16S | 検体中に含まれる全アーキア |
| カビ・酵母 ITS | ITS領域 | 検体中に含まれるカビ・酵母 |
〈腸内アーキア〉
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Methanobacteriaceae 科 | ー | ヒト腸内アーキアであるMethanobacteriaceae 科 (Methanobrevibacter およびMethanosphaera ) |
〈腸内細菌〉
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Clostridium cluster XVIII | ー | ヒト・動物腸管内のClostridium cluster XVIII |
| Clostridium perfringens (ウェルシュ菌) | 16S | 日和見感染菌であるC. perfringens (ウェルシュ菌) |
| Clostridium butyricum | ー | 酪酸を生成する偏性嫌気性芽胞形成グラム陽性桿菌 |
| Clostridium leptum | ー | ヒト・動物腸管内のC. leptum |
| Eggerthella 属 | ー | ヒト腸管内のEggerthella 属 |
| Enterococcus 属 | 16S | ヒト・動物腸管内および環境中のEnterococcus 属 |
| Enterococcus faecalis | ー | 食品中あるいは環境中のE. faecalis |
| Fusicatenibacter saccharivorans | ー | ヒト腸管内の優勢菌種であるF. saccharivorans |
| Fusobacterium 属 | ー | 臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内Fusobacterium 属 |
| Fusobacterium varium | ー | ヒト・動物腸管内のF. varium |
| Klebsiella pneumoniae | ー | ヒト・動物腸管内および口腔内 K. pneumoniae |
| Lactobacillus 属 | 16S | ヒト・動物腸管内の旧名Lactobacillus /Pediococcus /Weissella 属 |
| Lacticaseibacillus casei(Lactobacillus casei) | 16S | ヒト・動物腸管内のL . casei |
| Lactobacillus gasseri | ー | ヒト・動物腸管内のL . gasseri |
| Limosilactobacillus mucosae (Lactobacillus mucosae) | ー | ヒト・動物腸管内のL . mucosae |
| Parabacteroides 属 | ー | ヒト・動物腸管内の優勢菌であるParabacteroides 属 |
| Prevotella 属 | ー | ヒト・動物腸管内および口腔内Prevotella 属 |
| Streptococcus 属 | ー | ヒト・動物腸管内・口腔内のStreptococcus 属 |
| Sutterella 属 | ー | 胆汁耐性菌でAutism-associated bacteria として議論されているSutterella 属 |
| Veillonella 属 | ー | ヒト・動物腸管内および口腔内常在菌であるVeillonella 属 |
| Verrucomicrobiota 門 （Verrucomicrobia 門） | ー | ヒト・動物腸管内のVerrucomicrobiota 門（Verrucomicrobia 門） |
〈口腔内細菌〉
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Actinomyces 属 | ー | ヒト・動物腸管内および口腔内常在菌であるActinomyces 属 |
| Aggregatibacter actinomycetemcomitans | ー | 歯周病の原因菌として注目されているA. actinomycetemcomitans |
| Bacteroides fragilis | ー | ヒト・動物腸管内および口腔内B. fragilis |
| Campylobacter 属 | ー | 臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内Campylobacter 属 |
| Fusobacterium 属 | ー | 臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内Fusobacterium 属 |
| Leptotrichia 属 | ー | 口腔内常在菌であるLeptotrichia 属 |
| Prevotella 属 | ー | ヒト・動物腸管内および口腔内Prevotella 属 |
| Porphyromonas gingivalis | ー | ヒトの歯肉溝に生息し、歯周病の原因菌として注目されているP. gingivalis |
| Streptococcus mutans | ー | う蝕に関与するS. mutans |
| Streptococcus intermedius | ー | ヒト口腔内常在菌であるS. intermedius |
| Staphylococcus aureus | ー | 臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内S. aureus |
| Treponema denticola | ー | 歯周病の原因菌として注目されているT. denticola |
| Tannerella forsythia | ー | 歯周病の原因菌として注目されているT. forsythia |
| Veillonella 属 | ー | ヒト・動物腸管内および口腔内常在菌であるVeillonella 属 |
〈皮膚常在菌〉
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Acinetobacter 属 | 16S | ヒト腸内・皮膚の常在菌であるAcinetobacter 属 |
| Staphylococcus aureus | ー | 臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔内S. aureus |
〈膣内菌〉
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Gardnerella vaginalis 属 | ー | 細菌性膣症の原因菌として知られているG. vaginalis |
〈膣内菌〉
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| 酢酸菌 | ー | 酢酸菌であるAcetobacter /Acidomonas /Gluconacetobacter / Gluconobacter /Kozakia /Tanticharoenia 属 |
| Alicyclobacillus 属 | ー | 耐熱性好酸性菌であるAlicyclobacillus 属 |
| Bacillus subtilis | ー | 食品中あるいは環境中のB. subtilis |
| Levilactobacillus brevis(Lactobacillus brevis ) | ー | 食品中のL . brevis |
| Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus | ー | 食品中のL . delbrueckii subsp. bulgaricus |
| Lactiplantibacillus paraplantarum (Lactobacillus paraplantarum ) | ー | 食品中のL . paraplantarum |
| Lactiplantibacillus plantarum (Lactobacillus plantarum ) | recA | 食品中あるいは環境中のL . plantarum |
| Streptococcus thermophilus | ー | 食品中のS. thermophilus |
生体由来検体の返送
生体由来検体の返送をご希望のお客様には、定温マルチBOXによる臨床検体輸送サービスを利用してお送りします。
| 項目 | 容器サイズ（内寸） | 単位 | 価格 （税抜） | |
|---|---|---|---|---|
| 生体由来検体返送 （冷凍） | 10サイズ | 230mm×230mm×200mm | 1個 | 38,600 円 |
| 追加 1個 | ＋ 13,650 円 | |||
| 50サイズ | 320mm×450mm×350mm | 1個 | 66,700 円 | |
| 追加 1個 | ＋ 40,700 円 | |||