掲載以外の特定分類群や特定機能遺伝子 (ターゲット) はお問い合わせ下さい。
表中の16Sおよび23Sの表記は、16S rRNA遺伝子 (16S rDNA) および23S rRNA遺伝子 (23S rDNA) を意味します。
表中の備考にKit（Cat.〇〇〇）と記載されている分類群は、当社で販売しているリアルタイムPCR用定量キットを使用し解析を行います。
リアルタイムPCR用定量キットに使用するプライマー配列は開示していません。
全菌数
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| 全真正細菌 | 16S | 検体中に含まれる全真正細菌 |
| 全アーキア | 16S | 検体中に含まれる全アーキア |
| カビ・酵母 ITS | ITS領域 | 検体中に含まれるカビ・酵母 |
腸内アーキア
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Methanobacteriaceae 科 | ー | ヒト腸内アーキアであるMethanobacteriaceae 科 (Methanobrevibacter およびMethanosphaera) |
| Methanobacteriaceae Detection Kit (Cat. No. RM-0001) 使用 |
腸内細菌
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Akkermansia muciniphila | 16S | 腸管内のムチン分解菌であるA. muciniphila |
| Anaerostipes 属 | ー | ヒト腸管内の優勢菌種であるAnaerostipes 属 |
| Anaerostipes Detection Kit (Cat. No. RI-0017) 使用 | ||
| Bacillota (Firmicutes 門) | 16S | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌であるBacillota 門(Firmicutes 門) |
| Bacteroidetota ( Bacterioidetes 門) | 16S | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌であるBacteroidetota 門( Bacterioidetes 門) |
| Bacteroidales 目 | 16S | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌であるBacteroidales 目 (Bacteroides /Phocaericola /Prevotella /Porphyromonas 属など ) |
| Bacteroides 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌である旧Bacteroides 属 (Bacteroides 属および Phocaeicola 属) |
| Bacteroides Detection Kit (Cat. No. RI-0011) 使用 | ||
| Bacteroides fragilis | ー | ヒト・動物腸管内および口腔内B. fragilis |
| Bacteroides fragilis Detection Kit (Cat. No. RO-0003) 使用 | ||
| Bifidobacterium 属 | 16S | ヒト腸管内の優勢乳酸菌であるBifidobacterium 属 |
| Bifidobacterium bifidum | 16S | ヒト小児腸管内の優勢菌であるB. bifidum |
| Bifidobacterium breve | 16S | ヒト小児腸管内の優勢菌であるB. breve |
| Bifidobacterium longum | 16S | 食品中あるいは腸管内のB. longum |
| Bifidobacterium longum subsp. longum | tuf | 食品中あるいは腸管内のB. longum subsp. longum |
| Bifidobacterium pseudocatenulatum | groEL | 腸管内のB. pseudocatenulatum |
| Bilophila wadsworthia | ー | 胆汁により発育が促進され, β-ラクタム薬に高度耐性をもつB. wadsworthia |
| Bilophila wadsworthia Detection Kit (Cat. No. RI-0009) 使用 | ||
| Blautia 属 | ー | ヒト腸管内の最優勢菌種であるBlautia 属 |
| Blautia Detection Kit (Cat. No. RI-0008) 使用 | ||
| Campylobacter 属 | ー | 臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Campylobacter 属 |
| Campylobacter Detection Kit (Cat. No. RO-0006) 使用 | ||
| Candidate Division TM7 | 16S | 炎症性腸疾患との関わりが注目されている Candidate Division TM7 |
| Cetobacterium 属 | ー | ヒト腸管内Fusobacteria 門細菌であるCetobacterium 属 |
| Cetobacterium Detection Kit (Cat. No. RI-0016) 使用 | ||
| Christensenella minuta | ー | 痩せ型のヒトに多いとされるC. minuta |
| Christensenella minuta Detection Kit (Cat. No. RI-0015) 使用 | ||
| Clostridium cluster I & II | 16S | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌種であり狭義のClostridium 属菌である Clostridium cluster I および II |
| Clostridium cluster IV | ー | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌種であるClostridium cluster IV |
| Clostridium cluster IV Detection Kit (Cat. No. RI-0001) 使用 | ||
| Clostridium cluster XI | 16S | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌種であるClostridium cluster XI |
| Clostridium cluster XIV | 16S | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌種であるClostridium cluster XIV |
| Clostridium cluster XV | ー | ヒト ・ 動物腸管内のClostridium cluster XV |
| Clostridium cluster XV Detection Kit (Cat. No. RI-0002) 使用 | ||
| Clostridium cluster XVI ～ XVIII | ー | ヒト ・ 動物腸管内のClostridium cluster XVI、 XVII および XVIII |
| Clostridium cluster XVI ・ XVII ・ XVIII Detection Kit (Cat. No. RI-0006) 使用 | ||
| Clostridium cluster XVIII | ー | ヒト ・ 動物腸管内のClostridium cluster XVIII |
| Clostridium cluster XVIII Detection Kit (Cat. No. RI-0003) 使用 | ||
| Clostridium perfringens ( ウェルシュ菌 ) | 16S | 日和見感染菌であるC. perfringens ( ウェルシュ菌 ) |
| Clostridium butyricum | ー | 酪酸を生成する偏性嫌気性芽胞形成グラム陽性桿菌 |
| Clostridium butyricum Detection Kit (Cat. No. RI-0004) 使用 | ||
| Clostridium leptum | ー | ヒト ・ 動物腸管内のC. leptum |
| Clostridium leptum Detection Kit (Cat. No. RI-0007) 使用 | ||
| Peptacetobacter hiranonis および Clostridium scindens | baiCD | 7 α -dehydroxylase 活性を有するP. hiranonis およびC. scindens |
| Clostridium hylemonae およびC. scindens | baiJ | 7 α -dehydroxylase 活性を有するC. hylemonae およびC. scindens |
| Clostridioides difficile | 16S | 偽膜性腸炎、 抗菌薬関連下痢症に関与するC. difficile |
| Coriobacteriaceae 科 | 16S | ヒト腸内細菌の優勢菌であるCoriobacteriaceae 科 (Atopobium /Collinsella /Eggerthella 属 ) |
| Eggerthella 属 | ー | ヒト腸管内のEggerthella 属 |
| Eggerthella Detection Kit (Cat. No. RI-0021) 使用 | ||
| Enterobacteriaceae 科 | 16S | ヒト ・ 動物腸管内常在菌である腸内細菌科 (E.coli , Shigella etc.) |
| Enterococcus 属 | 16S | ヒト ・ 動物腸管内および環境中のEnterococcus 属 |
| Enterococcus faecalis | ー | 食品中あるいは環境中のE. faecalis |
| Enterococcus faecalis Detection Kit (Cat. No. RF-0003) 使用 | ||
| Enterococcus faecium | recA | ヒト ・ 動物腸管内および環境中のE. faecium |
| Escherichia coli／Shigella 属 | 16S | ヒト ・ 動物腸管内および環境中の大腸菌 (E.coli およびShigella 属) |
| Faecalibacterium prausnitzii | 16S | ヒト腸管内の優勢菌種であるF. prausnitzii およびその近縁菌種 |
| Fusicatenibacter saccharivorans | ー | ヒト腸管内の優勢菌種であるF. saccharivorans |
| Fusicatenibacter saccharivorans Detection Kit (Cat. No. RI-0020) 使用 | ||
| Fusobacteriota 門（Fusobacteria 門） | 16S | 臨床細菌学的に重要なヒト ・ 動物腸管内および口腔内 Fusobacteriota 門（Fusobacteria 門） |
| Fusobacterium 属 | ー | 臨床細菌学的に重要な、 ヒト・ 動物腸管内および口腔内Fusobacterium 属 |
| Fusobacterium Detection Kit (Cat. No. RO-0005) 使用 | ||
| Fusobacterium varium | ー | ヒト ・ 動物腸管内のF. varium |
| Fusobacterium varium Detection Kit (Cat. No. RI-0005) 使用 | ||
| Fusobacterium nucleatum | 16S | 臨床細菌学的に重要なF. nucleatum |
| Helicobacter 属 | 16S | ヒト胃腸間内の常在菌であるHelicobacter 属 |
| Klebsiella pneumoniae | ー | ヒト ・ 動物腸管内および口腔内 K. pneumoniae |
| Klebsiella pneumoniae Detection Kit (Cat. No. RI-0014) 使用 | ||
| Lacticaseibacillus casei ( Lactobacillus casei ) | 16S | ヒト ・ 動物腸管内のL . casei |
| Lacticaseibacillus casei ( Lactobacillus casei ) group | 16S | ヒト ・ 動物腸管内のL . casei, L. paracasei, L. rhamnosus およびL . zeae |
| Lactobacillus 属 | 16S | ヒト ・ 動物腸管内の旧名Lactobacillus /Pediococcus /Weissella 属 |
| Lactobacillus gasseri | ー | ヒト ・ 動物腸管内のL . gasseri |
| Lactobacillus gasseri Detection Kit (Cat. No. RI-0010) 使用 | ||
| Limosilactobacillus fermentum ( Lactobacillus fermentum ) | 16S | ヒト ・ 動物腸管内のL . fermentum |
| Limosilactobacillus mucosae (Lactobacillus mucosae ) | ー | ヒト ・ 動物腸管内のL . mucosae |
| Limosilactobacillus mucosae Detection Kit (Cat. No. RI-0019) 使用 | ||
| Lancefieldella parvula （Atopobium parvulum ） | 16S | 大腸がんとの関連が疑われているL. parvula （A. parvulum ） |
| Peptostreptococcus stomatis | ー | 大腸がん病巣から高頻度に検出されるP. stomatis |
| Peptostreptococcus stomatis Detection Kit (Cat. No. RI-0018) 使用 | ||
| Parabacteroides 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌であるParabacteroides 属 |
| Parabacteroides Detection Kit (Cat. No. RI-0013) 使用 | ||
| Prevotella 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Prevotella 属 |
| Prevotella Detection Kit (Cat. No. RO-0004) 使用 | ||
| Proteus 属 | 16S | ヒト ・ 動物腸管内および環境中のProteus 属 |
| Proteus mirabilis | ureA | 尿路感染症に関連するP. mirabilis |
| Pseudomonas 属 | 16S | ヒト ・ 動物腸管内および環境中のPseudomonas 属 |
| Pseudomonas aeruginosa | gyrB | ヒト ・ 動物腸管内および環境中に存在し、 緑膿菌感染症の原因となるP. aeruginosa |
| Roseburia／Agathobacter rectalis group | 16S | ヒト ・ 動物腸管内の Roseburia/Agathobacter rectalis group |
| Roseburia 属 | 16S | ヒト腸管内の酪酸産生菌であるRoseburia 属 (R. inulinivorans 除く ) |
| Salmonella 属 | invA | ヒトや動物の消化管に生息し、 一部がヒトや動物に感染して病原性を示す Salmonella 属 |
| Staphylococcus 属 | 16S | ヒト ・ 動物腸管内および環境中のStaphylococcus 属 |
| Staphylococcus aureus | ー | 臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内S. aureus |
| Staphylococcus aureus Detection Kit (Cat. No. RO-0009) 使用 | ||
| Streptococcus 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内 ・ 口腔内のStreptococcus 属 |
| Streptococcus Detection Kit (Cat. No. RO-0001) 使用 | ||
| Streptococcus bovis | 16S | ルーメン細菌であるS. bovis (S. equinus) |
| Sutterella 属 | ー | 胆汁耐性菌でAutism-associated bacteria として議論されているSutterella 属 |
| Sutterella Detection Kit (Cat. No. RI-0012) 使用 | ||
| Thomasclavelia ramosa (Clostridium ramosum) | ー | ヒト ・ 動物腸管内の T. ramosa |
| Thomasclavelia ramosa Detection Kit (Cat. No. RI-0022) 使用 | ||
| Veillonella 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内および口腔内常在菌であるVeillonella 属 |
| Veillonella Detection Kit (Cat. No. RO-0007) 使用 | ||
| Verrucomicrobiota 門 （Verrucomicrobia 門） | ー | ヒト ・ 動物腸管内の Verrucomicrobiota 門 （Verrucomicrobia 門） |
口腔内細菌
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Actinomyces 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内および口腔内常在菌であるActinomyces 属 |
| Actinomyces Detection Kit (Cat. No. RO-0008) 使用 | ||
| Aggregatibacter actinomycetemcomitans | ー | 歯周病の原因菌として注目されているA. actinomycetemcomitans |
| Aggregatibacter actinomycetemcomitans Detection Kit (Cat. No. RO-0011) 使用 | ||
| Bacteroides fragilis | ー | ヒト ・ 動物腸管内および口腔内B. fragilis |
| Bacteroides fragilis Detection Kit (Cat. No. RO-0003) 使用 | ||
| Campylobacter 属 | ー | 臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Campylobacter 属 |
| Campylobacter Detection Kit (Cat. No. RO-0006) 使用 | ||
| Candidate Division TM7 | 16S | 歯周炎との関わりが注目されている Candidate Division TM7 |
| Fusobacterium 属 | ー | 臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Fusobacterium 属 |
| Fusobacterium Detection Kit (Cat. No. RO-0005) 使用 | ||
| Fusobacterium nucleatum | 16S | 歯周病の原因菌として注目されているF. nucleatum |
| Leptotrichia 属 | ー | 口腔内常在菌であるLeptotrichia 属 |
| Leptotrichia Detection Kit (Cat. No. RO-0012) 使用 | ||
| Prevotella 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Prevotella 属 |
| Prevotella Detection Kit (Cat. No. RO-0004) 使用) | ||
| Prevotella intermedia | 16S | ヒト口腔内常在菌であるP. intermedia |
| Porphyromonas gingivalis | ー | ヒトの歯肉溝に生息し、 歯周病の原因菌として注目されているP. gingivalis |
| Porphyromonas gingivalis Detection Kit (Cat. No. RO-0010) 使用 | ||
| Streptococcus 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内 ・ 口腔内のStreptococcus 属 |
| Streptococcus Detection Kit (Cat. No. RO-0001) 使用 | ||
| Streptococcus mutans | ー | う蝕に関与するS. mutans |
| Streptococcus mutans Detection Kit (Cat. No. RO-0002) 使用 | ||
| Streptococcus intermedius | ー | ヒト口腔内常在菌であるS. intermedius |
| Streptococcus intermedius Detection Kit (Cat. No. RO-0015) 使用 | ||
| Streptococcus oralis | gtfR | ヒト口腔内常在菌であるS. oralis |
| Staphylococcus aureus | ー | 臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内S. aureus |
| Staphylococcus aureus Detection Kit (Cat. No. RO-0009) 使用 | ||
| Treponema denticola | ー | 歯周病の原因菌として注目されているT. denticola |
| Treponema denticola Detection Kit (Cat. No. RO-0013) 使用 | ||
| Tannerella forsythia | ー | 歯周病の原因菌として注目されているT. forsythia |
| Tannerella forsythia Detection Kit (Cat. No. RO-0014) 使用 | ||
| Veillonella 属 | ー | ヒト ・ 動物腸管内および口腔内常在菌であるVeillonella 属 |
| Veillonella Detection Kit (Cat. No. RO-0007) 使用 |
皮膚常在菌
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Acinetobacter 属 | 16S | ヒト腸内 ・ 皮膚の常在菌であるAcinetobacter 属 |
| Cutibacterium acnes | grpE | 皮膚の常在菌であるC. acnes |
| Staphylococcus aureus | ー | 臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔S. aureus |
| Staphylococcus aureus Detection Kit （Cat. No. RO-009）使用 | ||
| Staphylococcus epidermidis | gmk | 表皮ブドウ球菌であるS. epidermidis |
| Staphylococcus warneri | sodA | 皮膚の常在菌であるS. warneri |
膣内菌
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Gardnerella vaginalis | ー | 細菌性膣症の原因菌として知られているG. vaginalis |
| Gardnerella vaginalis Detection Kit (Cat. No. RV-0001) 使用 |
環境水（海水・地下水など）
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Aeromonas 属 | ー | 河川水、 泥土、 魚や貝類から分離され、 下痢症と関連するAeromonas 属 |
| Aeromonas Detection Kit (Cat. No. RE-0001) 使用 | ||
| Legionella 属 | ー | 水系、 土壌など広く自然界に分布するLegionella 属 |
| Legionella Detection Kit (Cat. No. RE-0005) 使用 | ||
| Legionella pneumophila | mip | 水系、 土壌など広く自然界に分布し、 レジオネラ肺炎の原因菌であるL. pneumophila |
| Listeria 属 | prsA | 食品中あるいは環境中のListeria 属 |
| Listeria monocytogenes | hlyA | 食品中あるいは環境中のL. monocytogenes |
| Serratia marcescens | gyrB | 水、 土壌、 牛乳などから腐生菌として検出されるS. marcescens |
| Vibrio 属 | ftsZ | 自然界では海水などの水中に多く存在する環境中の常在細菌であるVibrio 属 |
| Vibrio vulnificus | vvh | 海水や海泥、 そこに生息する魚介類に広く分布し、 感染性胃腸炎や重篤な敗血症の原因になるV. vulnificus |
| Vibrio parahaemolyticus | tlh | 海水に広く存在し、食中毒の原因菌である腸炎ビブリオV.parahaemolyticus |
食品
| 対象菌種（分類群） | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Alicyclobacillus 属 | ー | 耐熱性好酸性菌であるAlicyclobacillus 属 |
| Alicyclobacillus Detection Kit (Cat. No. RF-0002) 使用 | ||
| Bacillus subtilis | ー | 食品中あるいは環境中のB. subtilis |
| Bacillus subtilis Detection Kit (Cat. No. RF-0009) 使用 | ||
| Bifidobacterium animalis subsp. lactis | 16S-23S | 食品中あるいは環境中のB. animalis subsp. lactis |
| Bifidobacterium longum | 16S | 食品中あるいは環境中のB. longum |
| Enterococcus faecalis | ー | 食品中あるいは環境中のE. faecalis |
| Enterococcus faecalis Detection Kit (Cat. No. RF-0003) 使用 | ||
| Lacticaseibacillus rhamnosus (Lactobacillus rhamnosus ) | 16S | 食品中あるいは環境中のL . rhamnosus |
| Lactiplantibacillus paraplantarum (Lactobacillus paraplantarum ) | ー | 食品中のL . paraplantarum |
| Lactiplantibacillus paraplantarum Detection Kit (Cat. No. RF-0008) 使用 | ||
| Lactiplantibacillus plantarum (Lactobacillus plantarum ) | recA | 食品中あるいは環境中のL . plantarum |
| Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus | ー | 食品中のL . delbrueckii subsp. bulgaricus |
| Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus Detection Kit (Cat. No. RF-0005) 使用 | ||
| Lactobacillus helveticus | ー | 食品中のL . helveticus |
| Lactobacillus helveticus Detection Kit (Cat. No. RF-0007) 使用 | ||
| Lactococcus lactis | ー | 食品中あるいは環境中のL . lactis |
| Lactococcus lactis Detection Kit (Cat. No. RF-0010) 使用 | ||
| Lactococcus cremoris | ー | 食品中あるいは環境中のL . cremoris |
| Lactococcus cremoris Detection Kit (Cat. No. RF-0011) 使用 | ||
| Leuconostoc mesenteroides | ー | 食品中あるいは環境中のL. mesenteroides |
| Leuconostoc mesenteroides Detection Kit (Cat. No. RF-0012) 使用 | ||
| Levilactobacillus brevis (Lactobacillus brevis ) | ー | 食品中のL . brevis |
| Levilactobacillus brevis Detection Kit (Cat. No. RF-0006) 使用 | ||
| Listeria 属 | prsA | 食品中あるいは環境中のListeria属 |
| Listeria monocytogenes | hlyA | 食品中あるいは環境中のL. monocytogenes |
| Pediococcus pentosaceus | recA | 食品中あるいは環境中のP. pentosaceus |
| Saccharomyces cerevisiae | nmd3 | 食品中あるいは環境中のS. cerevisiae |
| Streptococcus thermophilus | ー | 食品中のS. thermophilus |
| Streptococcus thermophilus Detection Kit (Cat. No. RF-0004) 使用 | ||
| Tetragenococcus halophilus | 16S | 食品中あるいは環境中のT. halophilus |
| Weizmannia coagulans ( Bacillus coagulans ) | 16S | 食品中あるいは環境中のW. coagulans |
| 芽胞菌 | spo0A | 食品中あるいは環境中の芽胞菌 (Bacillus属 /Geobacillus属 /Anoxybacillus属 etc) |
| 酢酸菌 | ー | 酢酸菌であるAcetobacter /Acidomonas /Gluconacetobacter/ Gluconobacter /Kozakia/Tanticharoenia 属 |
| Acetic acid bacteria Detection Kit (Cat. No. RF-0001) 使用 |
環境アーキア
| 対象菌種 ( 分類群 ) | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| メタン菌 | mcrA | メタン生成菌が有するメタン酵素遺伝子 (mcrA) |
| Methanothrix 属 | 16S | メタン発酵漕内の優占菌種であるMethanothrix 属 |
| Methanosarcina 属 | 16S | メタン発酵漕内の優占菌種であるMethanosarcina 属 |
| Methanoculleus 属 | 16S | メタン発酵漕内の優占菌種であるMethanoculleus 属 |
| Methanobacteriaceae 科 | ー | ヒト腸内アーキアであるMethanobacteriaceae 科（Methanobrevibacter 属およびMethanosphaera 属） |
| Methanobacteriaceae Detection Kit (Cat. No. RM-0001) 使用 | ||
| Methanolobus 属 | 16S | メタン菌であるMethanolobus 属 |
| Methanospirillum 属 | ー | メタン菌であるMethanospirillum 属 |
| Methanospirillum Detection Kit (Cat. No. RM-0002) 使用 | ||
| Methanomethylovorans 属 | ー | メタン菌であるMethanomethylovorans 属 |
| Methanomethylovorans Detection Kit (Cat. No. RM-0003) 使用 |
バイオ浄化
| 対象菌種 ( 分類群 ) | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Dehalobacter 属 | 16S | 検体中に含まれるDehalobacter 属 |
| Dehalococcoides 属 | 16S | 検体中に含まれるDehalococcoides 属 |
| Dehalococcoides 属 | bvcA | DCEs あるいは VC からエチレンへの分解酵素遺伝子であるbvcA遺伝子 |
| Dehalococcoides 属 | vcrA | DCEs あるいは VC からエチレンへの分解酵素遺伝子であるvcrA遺伝子 |
| Dehalococcoides 属 | tceA | TCE から塩化ビニル VC への分解酵素遺伝子であるtceA遺伝子 |
バイオリーチング
| 対象菌種 ( 分類群 ) | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| Acidithiobacillus thiooxidans | 16S | 硫黄酸化に関係する A. thiooxidans |
| Sulfobacillus 属 | 16S | バイオリーチングで使用されるSulfobacillus 属 |
微生物腐食
| 対象菌種 ( 分類群 ) | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| 硫酸還元菌 | dsrB | 金属の微生物腐食に関与する硫酸塩還元菌が有する硫酸塩還元酵素遺伝子 (dsrB) |
| 鉄細菌 (Leptothrix 属およびSphaerotilus 属) | ー | 金属の微生物腐食に関与する鉄細菌である Leptothrix 属およびSphaerotilus 属 |
| Leptothrix/Sphaerotilus Detection Kit (Cat. No. RE-0002) 使用 | ||
| 鉄細菌 (Gallionella 属およびSideroxydans 属) | ー | 金属の微生物腐食に関与する鉄細菌である Gallionella 属およびSideroxydans 属 |
| Gallionella/Sideroxydans Detection Kit (Cat. No. RE-0003) 使用 | ||
| 鉄細菌 (Prolixibacter 属) | ー | 金属の微生物腐食に関与する鉄細菌であるProlixibacter 属 |
| Prolixbacter Detection Kit (Cat. No. RE-0006) 使用 | ||
| 鉄酸化細菌 (Leptospirillum 属) | gyrB | 金属の微生物腐食に関与する鉄酸化細菌であるLeptospirillum 属 |
| 硫黄酸化細菌 | soxB | 金属の微生物腐食に関与する硫黄酸化細菌が有する硫黄酸化酵素遺伝子 (soxB) |
| 硫黄酸化細菌 (Acidithiobacillus 属) | 16S | soxB遺伝子を有しない硫黄酸化細菌であるAcidithiobacillus 属 |
| メタン菌 | mcrA | 金属の微生物腐食に関与するメタン生成菌が有するメタン酵素遺伝子 (mcrA) |
窒素循環（硝化／脱窒）
| 対象菌種 ( 分類群 ) | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| アンモニア酸化細菌 | amoA | アンモニア酸化細菌が有するアンモニア酸化酵素遺伝子 (amoA) |
| アンモニア酸化アーキア | arch-amoA | アンモニア酸化アーキアが有するアンモニア酸化酵素遺伝子 (arch-amoA) |
| Anammox 細菌 | hzo | 汚水処理の分野で注目されている嫌気的アンモニア酸化 (Anammox) 反応を担うAnammox細菌 |
| 亜硝酸還元菌 | nirS | 亜硝酸還元菌が有する亜硝酸還元酵素遺伝子 (nirS) |
| 亜硝酸還元菌 | nirK | 亜硝酸還元菌が有する亜硝酸還元酵素遺伝子 (nirK) |
| 窒素固定細菌 | nifH | 窒素固定細菌が有する窒素固定に関連するニトロゲナーゼ遺伝子 (nifH) |
| 亜酸化窒素還元菌 | nosZ | 亜酸化窒素還元菌が有する亜酸化窒素還元酵素遺伝子 (nosZ) |
| 亜硝酸酸化細菌 (Nitrobacter 属) | 16S | 亜硝酸酸化細菌であるNitrobacter 属 |
| 亜硝酸酸化細菌 (Nitrobacter 属) | norB | 亜硝酸酸化細菌であるNitrobacter属が有する亜硝酸酸化還元酵素遺伝子 (norB) |
| 亜硝酸酸化細菌 (Nitrospira 属) | 16S | 亜硝酸酸化細菌であるNitrospira 属 |
| Comammox Nitrospira clade A | amoA | 完全アンモニア酸化と考えられていNitrospira 菌 |
| Comammox Nitrospira clade B | amoA | 完全アンモニア酸化と考えられているNitrospira 菌 |
| Pseudomonas aeruginosa | gyrB | 窒素循環において重要な役割を担うP. aeruginosa |
その他
| 対象菌種 ( 分類群 ) | 遺伝子 | 備考 |
|---|---|---|
| メタン酸化細菌 | pmoA | メタン酸化細菌が有するメタンモノオキシゲナーゼ遺伝子 (pmoA) |
| 水素産生菌 | hydA | 検体中に含まれる水素産生菌 |
| Candidate Division TM7 | 16S | 活性汚泥、 環境水などに存在するCandidate Division TM7 |
| Thiothrix 属 | ー | 活性汚泥中の糸状性細菌であるThiothrix 属 |
| Thiothrix Detection Kit (Cat. No. RE-0004) 使用 | ||
| Alphaproteobacteria 綱 | 16S | 検体中に含まれるAlphaproteobacteria 綱 |