試験のポイント
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細菌、酵母の微生物株の異同を識別
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PFGE解析やMLST解析といった従来の識別手法に比べて迅速かつ安価
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分離された多数の微生物株のスクリーニングに有効
サービス概要
こんな方におすすめです
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製造に使用する種菌と製品中の微生物株が同一か確認したい方
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製品から汚染菌が発見された際に、複数の環境や原料から分離された同じ「種」の汚染源を特定したい方
- 対象
- 細菌、酵母
- 試験原理
- 同一条件で培養した微生物株の炭水化物・多糖類などの分子パターンを赤外線スペクトル(FT-IR)として取得し、そのスペクトルデータを比較解析することで、株レベルでの識別を行うシステムです。
- 対象フィールド
- 食品、製薬など幅広い分野
- 納期目安
- 8営業日~
- 解析領域
- 炭水化物、多糖類
- オプション
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①脂質
②脂質、炭水化物、多糖類
③炭水化物、タンパク質 の領域で解析
微生物株の新しい識別方法としてブルカージャパン株式会社によりIR Biotyperによる方法が提案されています。IR Biotyperは、同一条件で培養した異なる微生物株が持つ炭水化物・多糖類のフーリエ変換赤外 (FT-IR) スペクトルデータを取得し、微生物株間のスペクトルデータを比較解析することで株レベルの識別を行うシステムです。
菌株を識別する解析領域について、基本とする炭水化物、多糖類の他に、追加オプションで①脂質、②脂質、炭水化物、多糖類、③炭水化物、タンパク質の領域で解析することが可能です。
基本の解析領域ではホールゲノム解析と同等の識別結果を得られることが報告されています。また、追加オプションにより、菌体を構成する他の成分を基にした表現型での相同性の評価結果から株識別を行います。
微生物株識別とは?微生物種と何が違うのか?
微生物株の識別とは、微生物の分類階級において「種」よりもさらに低次の階級である「株」の違いを識別することを意味し、同一種であることが確かめられている微生物株同士の異同を推定することが目的です。特に食品・飲料製造工程において微生物株の識別は、品質管理の観点から重要性が高まっています。製造に用いる種菌と製品中に含まれる微生物株が同一であることの確認や、製品から汚染菌が発見された際に様々な環境や原料から同じ「種」が複数分離されたときの汚染源の特定 (どこから混入したのか?) のために、迅速な微生物株識別方法が注目されています。
受入可能な検体
精度の高い結果を得るためには3株以上での試験実施を推奨します。
| カテゴリー | 必要量 | 備考 |
|---|---|---|
| 細菌、酵母 | ・平板培養物 1 枚 ・スラント (斜面培養物)1 本 ・凍結保存品(グリセロールストック)1 本 ・アンプル 1 本 | 当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。 生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。 |
納品内容
| 試験項目 | 報告内容 | 付属データ |
|---|---|---|
| IR Biotyper 株識別試験 | • 距離行列とヒートマップ • クラスター分析によるデンドログラム • 主成分分析結果 | • png • csv ファイル |
報告書サンプル
解析プロセス
- 培養
- 懸濁
- 乾燥
- FT-IR測定
- データ解析
価格・納期
- 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。[追加費用]
- 試験を行う微生物株すべての培養日数を揃える必要があるため、最も生育が遅い株に合わせて試験を実施します。
- 目安納期は培養完了翌日より起算となります。
| 試験項目 | 検体数※1 | 単位 | 単価(税抜) | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|
| IR Biotyper 株識別試験 | 3 ~ 5 | 株 | 24,000 円 | 8 営業日 |
| 6 ~ | 18,000 円 | 9 営業日~ |
- 精度の高い結果を得るためには3株以上での試験実施を推奨します。
オプション|解析領域の追加
菌株を識別する解析領域について、基本とする炭水化物、多糖類の他に、追加オプションで①脂質、②脂質、炭水化物、多糖類、③炭水化物、タンパク質の領域で解析することが可能です。
追加オプションにより、菌体を構成する他の成分を基にした表現型での相同性の評価結果から株識別を行います。
| 試験項目※1 | 検体数 | 単位 | 単価(税抜) | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|
| 脂質 | 1 | 式 | 各 + 2,000 円 | + 1 営業日 |
| 脂質、炭水化物、多糖類 | 1 | |||
| 炭水化物、タンパク質 | 1 |
- 解析装置の設定のため組み合わせの変更はできません。