試験のポイント
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JMBC（日本マイクロバイオームコンソーシアム）推奨プロトコルに基づき、DNAを抽出し濃度測定結果とともに納品
サービス概要
- 試験項目
- 生体A DNA 抽出 (JMBC 推奨プロトコル)
- 受入可能な検体
- 糞便検体
- 目安納期
- 15 営業日～
- プロトコル
- JMBCが推奨する糞便メタゲノム解析推奨プロトコル
- オプション
- 秤量／PCR 増幅確認／二本鎖 (ds) DNA 濃度測定／糞便混錬作業
JMBCが推奨する糞便メタゲノム解析推奨プロトコル1,2)に基づきDNAを抽出します。
〈参考文献〉
1) Tourlousse DM, Narita K, Miura T, Sakamoto M, Ohashi A et al . Validation and standardization of DNA extraction and library construction methods for metagenomics-based human fecal microbiome measurements.Microbiome 2021;9:95.
2) JMBC糞便メタゲノム解析推奨プロトコル ver2.1.
http://www.jmbc.life/news/images/SOPv1.2.pdf
受入可能な検体
- 血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
- ヒト以外の糞便検体でのDNA抽出はご相談下さい。
| 検体区分 | 由来 | 検体の種類 |
|---|---|---|
| A 区分： 糞便検体 | ヒト | 糞便 |
必要検体量・送付方法
| 検体の種類 | 必要量 | 留意点および送付方法 | |
|---|---|---|---|
| A 区分： 糞便検体（ヒト） | 気密性の高い容器 | 0.2 ～ 0.5 g | 採取後速やかに冷凍保存、 冷凍輸送 |
| 糞便採取容器（保存液あり） | 0.2 ～ 0.5 g | 採取後速やかに冷蔵保存 冷蔵輸送推奨、 常温輸送可 | |
| メタボロキーパー®※1 |
- 保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。
解析プロセス
- 検体の秤量（オプション）
- 破砕
- 精製
- 濃度測定
仕様
| 使用機器またはキット | 内容 |
|---|---|
| ISOSPIN Fecal DNA | 糞便からの DNA 抽出～精製を実施します。 |
納品内容
TEバッファーに溶解したDNAを、70 μL以上納品します。吸光度測定によるDNA濃度測定結果を報告します。
| 報告納品内容 | 形式 |
|---|---|
| DNA 抽出物 | マイクロチューブ |
| DNA 濃度測定結果 | Excel ファイル |
価格・納期
| 試験項目 | 検体数 | 単位 | 単価（税抜） | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|
| DNA抽出 (JMBC 推奨プロトコル ) | 1 | 検体 | 12,000 円 | 15 営業日～ |
生体由来検体の返送
生体由来検体の返送をご希望のお客様には、定温マルチBOXによる臨床検体輸送サービスを利用してお送りします。
| 項目 | 容器サイズ（内寸） | 単位 | 価格 （税抜） | |
|---|---|---|---|---|
| 生体由来検体返送 （冷凍） | 10サイズ | 230mm×230mm×200mm | 1個 | 38,600 円 |
| 追加 1個 | ＋ 13,650 円 | |||
| 50サイズ | 320mm×450mm×350mm | 1個 | 66,700 円 | |
| 追加 1個 | ＋ 40,700 円 | |||
オプション｜秤量、PCR 増幅確認、二本鎖 (ds) DNA 濃度測定、糞便混錬作業
〈仕様〉
| 試験項目 | 内容 |
|---|---|
| 秤量 | DNA 抽出に使う検体量を秤量し、抽出を行います。 ( ※リアルタイムPCR 解析に使用する場合は必須) |
| PCR 増幅確認 | 16S rDNA のユニバーサルプライマーを用いてPCR 増幅の有無を確認します。 |
| 二本鎖 (ds) DNA 濃度測定 | 蛍光法によりQubit またはマイクロプレートリーダーで測定します。 |
| 糞便 混錬作業 | 均一化のための糞便の混錬作業です。同一検体を複数の容器でお送りいただき、それらをまとめて秤量する場合、混錬作業が必要な場合があります。 |
〈納品内容〉
| 報告納品内容 | 形式 |
|---|---|
| 秤量結果 | Excel ファイル |
| PCR 増幅確認結果 | jpg ファイル |
| 二本鎖 (ds) DNA 濃度測定結果 | Excel ファイル |
〈価格・納期〉
| 追加試験項目 | 検体数 | 単位 | 単価（税抜） | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|
| 秤量 | 1 | 検体 | 1,000 円～ | ＋ 2 営業日～ |
| PCR 増幅確認 | 1 | 6,000 円 | ＋ 5 営業日～ | |
| 二本鎖 (ds) DNA 濃度測定 ( 蛍光法 ) | 1 ～ 4 | 6,000 円 | ＋ 2 営業日～ | |
| 5 ～ 23 | 3,000 円 | |||
| 24 ～ | 2,000 円 | |||
| 糞便 混錬作業※1 | 1 | 2,000 円～ | お問い合わせ下さい |
- 均一化のための糞便の混練作業です。多量の検体を作業する場合、別途、処分費が必要となることがあります。詳細は当社までお問い合わせ下さい。