試験のポイント
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DNA塩基配列解析結果と形態観察のセットメニュー
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コロニー形態および細胞形態観察結果の顕微鏡写真付きで報告
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Aspergillus 属およびPenicillium属に特化したメニューも用意
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帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル付きで報告
サービス概要
こんな方におすすめです
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学会発表や特許取得などの研究や製品開発などで、微生物株の分類学的特徴を詳しく知りたい方
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より精度の高いカビの帰属種・近縁種を同定したい方。
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Aspergillus 属やPenicillium 属の近縁種をより詳細な同定をご希望される方
- 試験対象
- カビ
- 試験項目
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◎カビ Premium
・1遺伝子 + 形態観察 → 中間報告:DNA特急5営業日、通常10営業日/全報告:25営業日
・2遺伝子 + 形態観察 → 中間報告:10営業日/全報告:30営業日
◎カビ Premium(Aspergillus 属) → 中間報告:15営業日/全報告:36営業日
◎カビ Premium(Penicillium 属) → 中間報告:15営業日/全報告:36営業日 - オプション
- 総合考察(同定に至った経緯の文章説明)
カビの帰属種・近縁種を同定する際、当社がお薦めする試験セットです。「DNA塩基配列解析」と「形態観察」などの性状試験を組み合わせますので、DNA塩基配列解析単独での試験よりもより深い考察が可能となります。学会発表や特許取得などの研究や製品開発など、微生物株について、より詳細な情報を必要とするお客様に有効となり、近縁種の推定と分類学的な特徴付けが可能です。
また、Aspergillus 属やPenicillium 属では、rDNAのITS領域の塩基配列解析のみでは近縁種が区別できない例も多数報告されており、これらの分類群については、β-tubulinまたはcalmodulin遺伝子などの進化速度のより速い機能遺伝子を用いた解析が有効となります。当社では、これらの分類群のより詳細な同定をご希望されるお客様に、「機能遺伝子のDNA塩基配列解析」と「形態観察」もご用意しています。
1遺伝子:ITS rDNA または 28S rDNA-D1/D2
2遺伝子:ITS rDNA および 28S rDNA-D1/D2
中間報告:当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をメールで報告します。最終的な結論と異なる可能性があります。
DNA特急:5営業日で当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をメールで報告します。また、一度にお受けできる検体数は8株までです。多検体の場合は、優先順位をご指定ください。
受入可能な検体
| 種類 | 必要量 | 備考 |
|---|---|---|
| 平板培養物 | 1 枚 | 当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。 |
| 液体培養物 | 1 本 | |
| スラント(斜面培養物) | ||
| アンプル | ||
| 凍結保存品(グリセロールストック) |
解析プロセス
- 純度確認
- DNA抽出
- PCR増幅
- シーケンス(ITS rDNA)
- 塩基配列決定
- 相同性検索
- 分子系統解析
- カビ第一段階試験
- 文献調査
納品内容
| カテゴリー | 報告内容 | 付属データ |
|---|---|---|
| カビPremium | • 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 • 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位 • 系統樹(rDNAのITS領域※1, 2) • カビ形態観察 (カビ第一段階試験結果) • 同定結果 • 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル | • 巨視観察像 (コロニー) • 微視観察像 (形態) • DNA 塩基配列データ • シーケンス波形データ |
| カビPremium (Aspergillus 属 ) | • 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 (ITS rDNA) • 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位 (ITS rDNA) • 系統樹 (rDNAのITS領域) • 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 (機能遺伝子) • 系統樹 (β-tubulinまたはcalmodulin遺伝子) • カビ形態観察 (カビ第二段階試験結果) • 同定結果 • 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル | • 巨視観察像 (コロニー) • 微視観察像 (形態) • 分子系統樹ファイル(機能遺伝子のみ) • DNA塩基配列データ • シーケンス波形データ |
| カビPremium (Penicillium 属 ) |
- ITS領域は28S rDNA-D1/D2領域に変更可能です。
- ITS領域と28S rDNA-D1/D2領域の2遺伝子の解析に変更可能です。なお、解析は遺伝子領域ごとに行います。
報告書サンプル
価格・納期
- 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。[追加費用]
- 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
- DNA塩基配列データ、シーケンス波形データ、コロニーおよび形態観察時の写真などは、報告時にお届けします。
| 試験項目 | 単位 | 単価(税抜) | 中間報告※1 | 納期 |
|---|---|---|---|---|
| カビPremium (1 遺伝子 ) | 株 | 69,000 円 | 10 営業日 | 25 営業日 |
| カビPremium (1 遺伝子 )/DNA 特急※2 | 株 | 75,600 円 | 5 営業日 | 25 営業日 |
| カビPremium (2 遺伝子 ) | 株 | 94,000 円 | 10 営業日 | 30 営業日 |
| カビPremium(Aspergillus属 ) | 株 | 220,000 円 | 15 営業日 | 36 営業日 |
| カビPremium(Penicillium属 ) |
- 中間報告は、当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をメールで報告します。最終的な結論と異なる可能性があります。
- DNA特急は、5営業日で当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をメールで報告します。また、一度にお受けできる検体数は8株までです。
オプション|総合考察(同定に至った経緯の文章説明)
オプションで考察 (同定に至った経緯の文章説明) 付きに変更が可能です。
| 試験項目 | 報告内容 | 単位 | 単価(税抜) | 納期 |
|---|---|---|---|---|
| 総合考察 ( 1 遺伝子または2 遺伝子 ) | 同定に至った経緯の文章説明を追加します。※1 | 株 | + 13,000 円 | + 2 営業日~ |
| 総合考察 ( Aspergillus 属またはPenicillium 属 ) | + 21,000 円 | + 2 営業日~ |
- 菌の特性に関する内容の記載は対応いたしかねます。