試験のポイント
-
16S rDNAで種の識別が困難なLactiplantibacillus plantarumグループの同定に有効
-
近隣結合法 (NJ法) 、最節約法 (MP法) 、最尤法 (ML法) から選択可能
サービス概要
- 対象
- 細菌
- 試験項目
- recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarum）
- 納期
- 15営業日～
Lactiplantibacillus plantarumグループに含まれる菌種間では16S rDNA 塩基配列の差異が小さく、特にL. plantarumとL. pentosusの識別は非常に困難です。しかし、機能遺伝子であるrecA 遺伝子を解析することによりL. plantarumとL. pentosus の識別が可能です。
受入可能な検体
| 種類 | 必要量 | 備考 |
|---|---|---|
| 平板培養物 | 1 枚 | 当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。 |
| 液体培養物 | 1 本 | |
| スラント ( 斜面培養物 ) | ||
| アンプル | ||
| 凍結保存品 ( グリセロールストック) |
解析プロセス
- 純度確認
- DNA抽出
- PCR増幅
- シーケンス
- 塩基配列決定
- 分子系統解析
納品内容
| 試験項目 | 報告内容 | 付属データ |
|---|---|---|
| recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarum） | ・国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 ・分子系統解析に使用した配列の登録情報一覧 ・系統樹 ・考察 (同定に至った経緯の文章説明) ・同定結果 | ・ 分子系統樹ファイル （PowerPoint） ・ DNA塩基配列データ ・ シーケンス波形データ |
価格・納期
- 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。［追加費用］
- 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
- DNA塩基配列データ、シーケンス波形データおよび分子系統樹ファイルは、報告時にお届けします。
| 試験項目 | 単位 | 単価（税抜） | 目安納期 |
|---|---|---|---|
| recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarum） | 式 | 64,000 円 | 15営業日～ |