試験のポイント
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DNA塩基配列解析結果と生理・生化学的性状試験のセットメニュー
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基準株のDNA塩基配列解析の結果を踏まえ、分類学的な特徴付けに有効な生理・生化学的性状試験項目を選定
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帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル付きで報告
サービス概要
こんな方におすすめです
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学会発表や特許取得などで、微生物株の分類学的特徴を詳しく知りたい方
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DNA塩基配列解析だけではなく、形態観察や生理・生化学的性状試験も組み合わせてより精度の高い帰属種・近縁種を推定したい方
- 試験対象
- 細菌
- 試験内容
- 16S rDNA-Full＋形態観察＋生理・生化学的性状試験
- 納期
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◎中間報告（相同性検索結果上位5位のみを報告）
・DNA特急5営業日
・通常10営業日
◎全報告：30営業日 - オプション
- 総合考察（同定に至った経緯の文章説明）
16S rDNAの全長解析である「16S rDNA-Full」と「形態観察」や「生理・生化学的性状試験」などの性状試験を組み合わせたメニューです。DNA塩基配列解析のみの試験に比べ、より精度の高い帰属種・近縁種の推定が期待できます。学会発表や特許取得の際のデータ取得など、微生物株についてより詳細な情報を必要とするお客様に有効となり、当該微生物株の分類学的な特徴付けが可能です。
中間報告：当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をメールで報告します。最終的な結論と異なる可能性があります。
DNA特急：5営業日で当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をメールで報告します。また、一度にお受けできる検体数は8株までです。多検体の場合は、優先順位をご指定ください。
受入可能な検体
| 種類 | 必要量 | 備考 |
|---|---|---|
| 平板培養物 | 1 枚 | 当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。 |
| 液体培養物 | 1 本 | |
| スラント（斜面培養物） | ||
| アンプル | ||
| 凍結保存品（グリセロールストック） |
解析プロセス
- 純度確認
- DNA抽出
- PCR増幅
- シーケンス
- 塩基配列決定
- 相同性検索
- 分子系統解析
- 文献調査
- 細菌第一段階試験
- 細菌第二段階試験
納品内容
| カテゴリー | 報告内容 | 付属データ |
|---|---|---|
| 細菌Premium | • 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位 • 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位 • 系統樹 • 細菌第一段階試験結果 • 細菌第二段階試験結果 • 帰属種・近縁種の同定に有効な追加試験 • 同定結果 • 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル | • コロニー像 • 細胞形態またはグラム染色像 • DNA 塩基配列データ • シーケンス波形データ |
報告書サンプル
価格・納期
- 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。［追加費用］
- 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
- DNA塩基配列データ、シーケンス波形データ、コロニーおよび形態観察時の写真などは、報告書と一緒に納品します。
| 試験項目 | 単位 | 単価（税抜） | 中間報告※1 | 納期 |
|---|---|---|---|---|
| 細菌 Premium | 株 | 135,000 円 | 10 営業日 | 30 営業日 |
| 細菌 Premium／DNA 特急※2 | 株 | 146,100 円 | 5 営業日 |
- 中間報告は、当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をメールで報告します。最終的な結論と異なる可能性があります。
- DNA特急は、5営業日で当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をメールで報告します。また、一度にお受けできる検体数は8株までです。
オプション｜総合考察（同定に至った経緯の文章説明）
オプションで考察 (同定に至った経緯の文章説明) 付きに変更が可能です。
| 試験項目 | 報告内容 | 単位 | 単価（税抜） | 納期 |
|---|---|---|---|---|
| 総合考察 | 同定に至った経緯の文章説明を追加します。※1 | 株 | ＋ 11,000 円 | ＋ 2 営業日～ |
- 菌の特性に関する内容の記載は対応いたしかねます。