お知らせ

アンプリコンシーケンス解析で使用するデータベースを、以下のとおり最新版へ更新しました。

• 当社オリジナルデータベース「NGS-DB-BA」：version 17.0 → version 19.0
• RDP Classifier：version 2.13 → version 2.14

これに伴い、2025年10月より順次、新しいデータベースを用いて解析結果をご報告いたします。

新しい解析データベース「NGS-DB-BA version 19.0」は、当社微生物同定システム「ENKI®」のDB-BA version 19.0 (収録数: 3778属、20974種、450亜種) をアンプリコンシーケンス解析用にカスタマイズしたデータベースです。
NGS-DB-BA version 19.0に収録された細菌・アーキア基準株の16S rDNA塩基配列は、2025年4月までに記載・再分類された最新の分類体系に基づいています。

RDP Classifier version 2.14では、2023年に公開された細菌およびアーキアの最新分類情報を反映した学習用データセット（トレーニングセットNo.19）に更新されております。本アップデートでは、新たに記載された分類群や、近年の命名法における主要な変更が反映されています。登録されている配列数は24,642件、種数は19,074種、属数は3,903属となっており、前バージョン（No.18）と比較して、種数で2,313種（13.8%増）、属数で668属（20.6%増）の増加が見られます。

詳細は、以下の文献をご参照ください：
https://journals.asm.org/doi/10.1128/mra.01063-23

近年、微生物の分類体系は大きく見直されており、最新の系統分類が反映されております。
最新の分類体系については、LPSN: https://lpsn.dsmz.de/をご参照ください。

NGS-DB-BA version 17以降、一部の分類群では、より精確な微生物群集の把握を目的として、「種名の併記」や「グループ名（例：Escherichia coli/Shigella や Bacillus cereus group など）」で表示されるようになっています。
その詳細は、以下の表にてご確認いただけます。

最新の分類体系によるアンプリコンシーケンス解析をぜひご利用ください。
すでに、
  ・「NGS-DB-BA version 17.0」
  ・「RDP Classifier version 2.13」
で解析したデータも、
  ・「NGS-DB-BA version 19.0」
  ・「RDP Classifier version 2.14」
で再解析することが可能です（※再解析費用がかかります）。

ご希望があれば、旧バージョンでの解析も引き続き対応可能です。
なお、「NGS-DB-BA version 16.0」および「RDP Classifier version 2.11」による解析はサポート対象外となります。
詳しくはお気軽にお問い合わせください。

株式会社テクノスルガ・ラボ　営業部
📧 E-mail：tsl-contact@tecsrg.co.jp
📞 電話番号：054-349-6155

関連サービスリンク：

• 生体 アンプリコンシーケンス解析
• 生体 アンプリコンシーケンス解析（JMBC 推奨プロトコル）
• 環境 アンプリコンシーケンス解析
• アンプリコンシーケンスデータ解析（Metagenome＠KIN）