PFGE解析 (株識別)

説明 PFGE(パルスフィールドゲル電気泳動)解析は、ゲノムDNAを任意の制限酵素にて消化し、断片化されたDNA分子を電気泳動してバンドパターンを比較する方法です。断片化されたDNA分子は数百kb程度と大きいため、パルス

ANI (Average Nucleotide Identity) 解析

説明 ANI解析は、対象株(検体)と比較株のゲノム配列の類似度(ANI:相同値)をコンピュータ上で計算し、種の異同を判断します。ANI値が95%以上であれば同種、95%未満であれば別種と判定します。DNA-DNAハイブリ

DNA-DNAハイブリッド形成試験

説明 DNA-DNAハイブリッド形成試験は、対象菌株と比較菌株のゲノムDNAの相対的な結合(ハイブリッド形成)の割合から、同種、別種の判断を行う試験です。細菌および酵母の分類では、DNA相同値が70%以上であれば同種、7

鉄細菌 顕微鏡観察

説明 水中の溶存鉄や溶存マンガンを酸化し、菌体の内外に沈積する能力をもった一群の細菌は「鉄バクテリア」または「鉄細菌」と呼ばれています。これらの鉄細菌などを含めた糸状微生物(主に糸状細菌)は、溶存鉄を含む地下水が湧き出て