DGGE バンド塩基配列解析キット

説明

通常、DGGE バンド塩基配列解析においては、PCR プライマーと同一の2 種類のプライマーをシーケンスプライマーとして用いて両鎖で解析を行なっています。
サンガー法でのシーケンス解析は、現在、約800 bp 程度の塩基配列を得ることが可能であるにもかかわらず、約200 bp 程度のDGGE バンド由来のPCR 産物を両鎖で解析が行われることが一般的です。

その理由は、PCR 産物のダイレクトシーケンスを行う場合、プライマー領域直後の20 bp~30 bp ほどの塩基配列が得られないためです (図1 および図2)。そのため、PCR 産物の全長の塩基配列を得るためには、両鎖での解析に加えて、それぞれのシーケンスプライマーで得られた塩基配列を結合するアッセンブルが必要でした (図2)。

当社では、PCR プライマーならびにシーケンスプライマーに改良を加えることで、上記の問題を解決し、片鎖 (1 シーケンスプライマー) のDNA 塩基配列解析でプライマーサイトを含むDGGE バンド由来PCR 産物の全長の塩基配列 (約160bp) を解析できるキット (DGGE band sequencing kit for analysis of thebacterial V3 region) を開発しています (図3)。

本キットを用いることにより、1 シーケンス反応でDGGE バンド由来のPCR 産物の全長が解析可能です(図4)。

製品内容

製品内容 保存
  • PCR Primer Mix           100 μl ×1本
  • Sequencing Primer (10 pmol/μl)    20 μl ×1本
  • Positive Control        50 μl  ×1 本
-20℃
※ 3ヶ月以内は2~8℃で保存可能
image46_result

※ DNA 精製試薬、プライマーを除くPCR 反応試薬は、含みません。キット以外必要な試薬、機器などは、お客様でご用意下さい。

製品一覧

Cat. No.製品名
DS-0001DGGEバンド塩基配列解析キット
(細菌16S rDNA V3領域解析用)
DS-0002DGGEバンド塩基配列解析キット
(菌類28S rDNA D2領域解析用)
DS-0003DGGEバンド塩基配列解析キット
(アーキア16S rDNA V3領域解析用)

価格・納期

項目 数量 単位 価格  目安納期
DGGE バンド塩基配列解析キット 1 セット  93,000円 15営業日
(受注生産)

依頼書の入手と同意事項の確認

ご依頼前の同意事項、ご依頼前の同意事項(共通) およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。

・ 本キットに含まれるプライマーの塩基配列は、開示いたしません。また仕様は、予告なく変更することがあります。
・ 本製品は、研究用試薬ですので、ヒトへの医療、臨床診断には使用できません。本製品を用いた検査結果判定により発生する問題に関して、当社は一切の責任を負いません。
・ 本製品の再販、および本製品を改変し再販することに起因する損失・損害等については、当社では一切の責任を負いません。
・ Clostridium cluster の分類は、基本的にCOLLINS et al. (1994)の論文に基づきます。
・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。

分析のご依頼は、以下のファイルをダウンロード頂きお申し込み下さい。