PFGE解析 (株識別)
特 長
- 細菌の株の異同を識別
- 細菌の他、酵母（Saccharomyces cerevisiae）の核型判別も可能
概 要
PFGE（パルスフィールドゲル電気泳動）解析は、ゲノムDNA を任意の制限酵素にて消化し、断片化されたDNA 分子を電気泳動してバンドパターンを比較する方法です。断片化されたDNA 分子は数百kb 程度と大きいため、パルス電場にて電気泳動を行います。
DNA バンドパターンが一致するか否かによって、菌株の異同を推定する解析です。高い再現性と識別能を持ちますが、帰属種や菌株により適する制限酵素や電気泳動条件などが異なるため、事前に文献調査などが必要です。
製品や原材料、製造水、製造ライン、包装容器などの異なる分離源、または異なる時期に分離された菌株のうち、同じ菌種に帰属する複数の菌株について、株レベルの同一性確認を行います。
酵母（Saccharomyces cerevisiae）の株識別も可能です。酵母では制限酵素は使用せず、染色体DNA のバンドパターン（核型）により株の異同を推定します。
【解析可能種（一例）】
細菌
Escherichia coli、Hafnia alvei、Neisseria gonorrhoeae、Pseudomonas aeruginosa、Salmonella enterica、Streptococcus equi、Lactobacillus delbrueckii、Lactobacillus rhamnosus、Bifidobacterium animalis
酵母
Saccahromyces cerevisiae
受入可能な検体
| 種類 | 必要量 | 備考 |
|---|---|---|
| 細菌 酵母 | 平板培養物1 枚 斜面培養物 1 本 グリセロールストック 1 本 アンプル 1 本 | 当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。 コンタミネーションや純粋性に疑義がある場合には、連絡をいたします。 |
作業の流れ
- 培養
- プラグ作製
- 溶菌・除タンパク処理
- 制限酵素処理
- 電気泳動
- 判定
納品内容
| 製品名 | 報告内容 | 付属データ |
|---|---|---|
| PFGE解析 | ・電気泳動像 ・考察 | ・電気泳動像 |
報告書サンプル
価格・納期
| 製品名 | 内容（解析例） | 単位 | 単価 | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|
| PFGE解析 | 2株で、制限酵素1種類を用いた場合 ※制限酵素1種類で1株増えるごとに ＋26,000円／株 詳細はお問い合わせ下さい。 | 式 | 114,000円 | 2～8株：30営業日 （9株以上はお問合せ下さい） |
| 2株で、制限酵素2種類を用いた場合 | 式 | 170,000円 | ||
| 3株で、制限酵素2種類を用いた場合 | 式 | 201,000円 | ||
| 2株で、制限酵素3種類を用いた場合 | 式 | 226,000円 |
・常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などを指定の場合、追加費用が必要となります。（培養追加費用→ 検体送付と追加費用のご案内を参照下さい）
・PFGE 解析は、1 回につき16 株まで同時に泳動可能です（両端にマーカーを流します）。
<オプション>デンドログラム作成/DNA多型解析
| 製品名 | 単位 | 単価 | 目安納期 |
|---|---|---|---|
| デンドログラム作成／DNA多型解析 （3株以上で作成） | レーン（菌株） | 3,000円 | ＋5営業日 （10株以上はお問い合わせ下さい） |
依頼書の入手と同意事項の確認
ご依頼前の同意事項、ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。
・近縁種の文献に従ったプロトコールにて分析します。
・帰属種の異なる菌株は分析条件が異なるため、同時に解析することはできません。
・プロトコールの指定がある場合は、別途ご連絡下さい。
・菌株間の比較のため、最小検体数は2 株となります。
・ご依頼前の同意事項（共通）を必ずご確認下さい。
ご依頼は、以下のファイルをダウンロード頂きお申し込み下さい。