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PFGE解析

特 長

  • 細菌の微生物株の異同を識別
  • 酵母（Saccharomyces cerevisiae）の核型判別も可能
  • 機能性表示食品に使用されている微生物の株識別で利用実績あり

概 要

　パルスフィールドゲル電気泳動 (PFGE) 解析は、ゲノムDNAを任意の制限酵素にて消化し、断片化されたDNA分子を電気泳動してバンドパターンを比較する方法です。断片化されたDNA分子は数百kb程度と大きいため、パルス電場にて電気泳動を行います。DNAバンドパターンが一致するか否かによって、微生物株の異同を推定する解析です。高い再現性と識別能を持ちますが、帰属種や微生物株により適する制限酵素や電気泳動条件などが異なるため、事前に文献調査などが必要です。

　酵母 ( Saccharomyces cerevisiae ) の株識別も可能です。酵母では制限酵素は使用せず、染色体DNAのバンドパターン(核型) により株の異同を推定します。

【解析可能種（一例）】

細菌:Escherichia coli、Hafnia alvei、Neisseria gonorrhoeae、Pseudomonas aeruginosa、
Salmonella enterica、Streptococcus equi、Lactobacillus delbrueckii、Lacticaseibacillus rhamnosus、Bifidobacterium animalis、Bacillus subtilis group
酵母: Saccharomyces cerevisiae

・解析可能な種についてはお問い合わせ下さい。

受入可能な検体

種類必要量備考
細菌
酵母		平板培養物1 枚
斜面培養物 1 本
グリセロールストック 1 本
アンプル 1 本		当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。
生育性や純粋性に疑義がある場合には、連絡いたします。

作業の流れ

  • 培養
  • プラグ作製
  • 溶菌・除タンパク処理
  • 制限酵素処理（細菌のみ）
  • 電気泳動
  • 判定

納品内容

試験項目報告内容付属データ
PFGE解析・電気泳動像－

報告書サンプル

方法PFGE判定基準電気泳動像

価格・納期（一例）

株数が多い、制限酵素を複数用いる場合の価格および納期はお問い合わせ下さい。

試験項目内容（解析例）単位単価（税抜）目安納期
PFGE解析2株で、制限酵素1種類を用いた場合
※制限酵素1種類で1株増えるごとに　＋8,000円／株
　　詳細はお問い合わせ下さい。		式
128,000円
2～8株：30営業日
(9株以上はお問合せ下さい)
2株で、制限酵素2種類を用いた場合式
168,000円
3株で、制限酵素2種類を用いた場合式
191,000円
2株で、制限酵素3種類を用いた場合式
184,000円

・ 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】 追加費用、作業工程の実費・重複減額のご案内をご参照下さい。
・ PFGE解析は、1回につき16株まで同時に泳動可能です (両端にマーカーを流します)。

<オプション>

試験項目単位単価
（税抜）
目安納期
クラスター分析／DNA多型解析(3株以上で作成)レーン (株)
4,000円
＋5営業日
（10株以上はお問い合わせ下さい）

・ クラスター分析によるデンドログラム作成は、同一ゲル上のPFGEバンドパターンが得られる16株以内に限ります。

依頼書の入手と同意事項の確認

ご依頼前の同意事項、ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。

・ 機能性表示食品の届出のため作業手順書を発行する際は、発行費用　3,000円 (税抜)をご請求させていただきます。
・ 制限酵素の種類によっては、別途、制限酵素購入費用をご負担いただきます。
・ 近縁種の文献に従ったプロトコールにて解析します。
・ 帰属種の異なる微生物株は、解析条件が異なるため同時に解析することはできません。
・ プロトコールのご指定がある場合は、別途ご連絡下さい。
・ 微生物株間の比較のため、最小検体数は2株となります。
・ ご依頼前の同意事項（共通）を必ずご確認下さい。

ご依頼は、以下のファイルよりお申し込み下さい。

利用規約
分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認しました。

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