DNA-DNAハイブリッド形成試験
特 長
- ゲノム同士のハイブリッド形成度から、細菌、酵母の種の異同を決定
概 要
DNA-DNA ハイブリッド形成試験は、対象菌株と比較菌株のゲノムDNA の相対的な結合（ハイブリッド形成）の割合から、同種、別種の判断を行う試験です。細菌および酵母の分類では、DNA 相同値が70％以上であれば同種、70％未満であれば別種とされます。
試験は、「マイクロプレート法」で行います。測定は各組み合わせの表・裏で実施し、3 回繰り返した際の平均値で報告いたします。本試験では、ハイブリッドを形成させる際の温度条件を決定するため、別途G+C 含量値が必要です。
受入可能な検体
| 区分 | 必要検体量 | 送付方法 |
|---|---|---|
| 培養物 | 1枚 | 当社で培養を行います。培養条件を ご指示下さい。 コンタミネーションや純粋性に疑義が ある場合には、連絡をいたします。 |
| 液体培養物 | 1本 | |
| スラント （斜面培養物） | ||
| アンプル | ||
| グリセロールストック | ||
| 集菌体 | 目安湿重量 5ｇ以上 （右図参照） | 集菌後、5mM EDTA バッファで2～3 回 程度洗浄し、遠心・集菌後は凍結して 冷凍（クール便）でお送り下さい。 |
検体5g（湿重量）の目安量
・ 集菌体でご依頼の場合、抽出・分析の結果により、菌体の追加培養をお願いすることがあります。
解析の流れ
- 大量培養
- DNA抽出
- 粗精製
- 精製・超遠心
- 断片化
- プローブ作製
- ハイブリッド形成
- 測定
- 判定
報告書サンプル
価格・納期
| 製品名 | 単位 | 単価 （税抜） | 目安納期 | |
|---|---|---|---|---|
| DNA-DNA ハイブリッド形成試験 /培養あり | 式 | 1:1 のDNA ハイブリ試験の場合 | 313,000 円 | 6週間～ |
| 式 | 1:2のDNAハイブリ試験の場合 | 441,000円 | ||
| 式 | 3 株総当たりのDNA ハイブリ試験の場合 | 522,000 円 | ||
| DNA-DNA ハイブリッド形成試験 /培養なし | 式 | 1:1 のDNA ハイブリ試験の場合 | 232,000 円 | 5週間～ |
| 式 | 1:2のDNAハイブリ試験の場合 | 326,000円 | ||
| 式 | 3 株総当たりのDNA ハイブリ試験の場合 | 407,000 円 | ||
・ 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などを指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】 追加費用、作業工程の実費・重複割引のご案内をご参照下さい。
依頼書の入手と同意事項の確認
ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。
・ 当社で対照株を購入する場合、別途追加費用が必要となります。
・ 本試験は対象株（検体）の系統学的な解析が終了し、近縁種の絞り込みができていることが必要です。
・ ご依頼前の同意事項（共通）を必ずご確認下さい。。
ご依頼は、以下のファイルをダウンロード頂きお申し込み下さい。