DNA-DNAハイブリッド形成試験

特 長

  • ゲノム同士のハイブリッド形成度から、細菌、酵母の種の異同を決定

概 要

DNA-DNA ハイブリッド形成試験は、対象菌株と比較菌株のゲノムDNA の相対的な結合(ハイブリッド形成)の割合から、同種、別種の判断を行う試験です。細菌および酵母の分類では、DNA 相同値が70%以上であれば同種、70%未満であれば別種とされます。
試験は、「マイクロプレート法」で行います。測定は各組み合わせの表・裏で実施し、3 回繰り返した際の平均値で報告いたします。本試験では、ハイブリッドを形成させる際の温度条件を決定するため、別途G+C 含量値が必要です。

受入可能な検体

区分必要検体量送付方法
培養物1枚当社で培養を行います。培養条件を ご指示下さい。 コンタミネーションや純粋性に疑義が ある場合には、連絡をいたします。
液体培養物1本
スラント
(斜面培養物)
アンプル
グリセロールストック
集菌体目安湿重量
5g以上
(右図参照)
集菌後、5mM EDTA バッファで2~3 回 程度洗浄し、遠心・集菌後は凍結して 冷凍(クール便)でお送り下さい。

検体5g(湿重量)の目安量

・ 集菌体でご依頼の場合、抽出・分析の結果により、菌体の追加培養をお願いすることがあります。

解析の流れ

  • 大量培養
  • DNA抽出
  • 粗精製
  • 精製・超遠心
  • 断片化
  • プローブ作製
  • ハイブリッド形成
  • 測定
  • 判定

報告書サンプル

価格・納期

製品名単位単価
(税抜)
目安納期
DNA-DNA ハイブリッド形成試験
/培養あり
1:1 のDNA ハイブリ試験の場合313,000 円6週間~
1:2のDNAハイブリ試験の場合441,000円
3 株総当たりのDNA ハイブリ試験の場合522,000 円
DNA-DNA ハイブリッド形成試験
/培養なし
1:1 のDNA ハイブリ試験の場合232,000 円5週間~
1:2のDNAハイブリ試験の場合326,000円
3 株総当たりのDNA ハイブリ試験の場合407,000 円

・ 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などを指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】 追加費用、作業工程の実費・重複割引のご案内をご参照下さい。

依頼書の入手と同意事項の確認

ご依頼前の同意事項(共通) およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。

・ 当社で対照株を購入する場合、別途追加費用が必要となります。
・ 本試験は対象株(検体)の系統学的な解析が終了し、近縁種の絞り込みができていることが必要です。
・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。

ご依頼は、以下のファイルをダウンロード頂きお申し込み下さい。