環境関連 DNA抽出
特 長
- 環境検体からDNA を抽出し納品
概 要
様々な種類の環境検体からDNAを抽出します。
糞便からのDNA 抽出も承ります。『生体関連 DNA 抽出』をご覧下さい。
受入可能な検体
| 由来 | 検体の種類 |
|---|---|
| 食品 | 発酵食品などの食品試料 |
| 活性汚泥 | 活性汚泥試料 |
| 土壌 | 一般土壌、火山灰などの土壌系試料 |
| 発酵試料 | 堆肥、コンポスト、培養液等の発酵試料 |
| 環境水 | 海水、湖沼水などの水系試料 |
必要検体量・送付方法
| 検体の種類 | 必要量 | 留意点および送付方法 |
|---|---|---|
| 食品 | 10 gまたは100 mL | 食品の保存温度で保存、輸送 |
| 活性汚泥 | 5～10 mL | 採取後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送 |
| 土壌 | 1～5ｇ | |
| 堆肥 | ||
| コンポスト | ||
| 環境水※ （水道水、濁りの少ない河川水など） | 100mL～1000 mL | |
| 環境水※ （工業廃水、下水など） | 50～500 mL | |
| 培養液 | 5～10 mL |
※ 外洋海水、深海堆積物など、生物量が低いと考えられる試料についてはお問い合わせ下さい。
作業の流れ
- 検体の秤量（オプション）
- 破砕
- 精製
- 濃度測定
仕 様
| 抽出試薬例※ | 内容 |
|---|---|
| MORA-EXTRACT | 抽出～精製を左記キットで実施します。 |
| ISOIL for Beads Beating DNeusy Powerclean Pro Cleanup Kit |
※ 検体の種類によって、試薬、キットを変更します。他のDNA抽出キットを使用したDNA抽出をご希望の場合、お問い合わせ下さい。
納品内容・報告書サンプル
滅菌水もしくはTE バッファーで溶解したDNA を、70 μL 以上納品します。
吸光度にて測定したDNA 濃度測定結果をご報告いたします。
| 報告納品内容 | 形式 |
|---|---|
| DNA 抽出物 | 2.0 mLチューブ |
| DNA 濃度測定結果 | Excel ファイル |
価格・納期
| 試験項目 | 検体数 | 単位 | 単価 （税抜） | 納期 |
|---|---|---|---|---|
| DNA抽出 | 1 | 検体 | 11,000円 | 15営業日～ |
オプション
- 仕 様
| 試験項目 | 内容 |
|---|---|
| 秤量 | DNA抽出に使う検体量を秤量し、抽出を行います。 ※ リアルタイムPCR解析に使用する場合は必須となります。 |
| PCR増幅確認 | 16S rDNAのユニバーサルプライマーを用いてPCR増幅の有無を確認します。 |
| 二本鎖 (ds) DNA濃度測定（蛍光法） | 蛍光法によりQubitまたはマイクロプレートリーダーで測定します。 |
| 濃度調整 | TEバッファーで指定の濃度に希釈調整します。 ※ DNA抽出物が指定の濃度未満の場合、調整できません。 |
| ゲノムDNA電気泳動 | 0.5 %アガロースゲル電気泳動によりゲノムDNAのバンドを確認します。 ※ DNA濃度が低い場合は、バンドの確認ができないことがあります。 |
- 納品内容
| 報告内容 | 形式 |
|---|---|
| 秤量結果 | Excelファイル |
| PCR増幅確認結果 | jpgファイル |
| 二本鎖 (ds) DNA濃度測定結果 | Excelファイル |
| 濃度調整結果 | Excelファイル |
| ゲノムDNA電気泳動結果 | jpgファイル |
- 価格・納期
| 試験項目 | 検体数 | 単位 | 単価 （税抜） | 目安納期 |
|---|---|---|---|---|
| 秤量 | 1 | 検体 | 1,000円～ | ＋2営業日～ |
| PCR増幅確認 | 1 | 検体 | 6,000円 | ＋5営業日～ |
| 二本鎖 (ds) DNA濃度測定（蛍光法） | 1～4 | 検体 | 6,000円 | ＋2営業日～ |
| 5～23 | 検体 | 3,000円 | ||
| 24～ | 検体 | 2,000円 | ||
| 濃度調製 | 1 | 検体 | 1,000円 | ＋5営業日～ |
| ゲノムDNA電気泳動 | 1～7 | 検体 | 2,000円 | ＋5営業日～ |
| 8～ | お問い合わせ下さい |
依頼書の入手と同意事項の確認
ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認してお申込み下さい。
・ DNA抽出物の返送には、別途送料が必要となります。
・ 水滴などに伴う梱包材の軟化や破断による汚染等が考えられるため、発泡スチロールなどに梱包いただき、漏洩にご注意下さい。
・ 秤量および他分析項目を同時に行う場合には、検体の必要量が変わりますのでお問い合わせ下さい。
・ 本サービスは、当社の受託解析サービス (アンプリコンシーケンス解析、リアルタイムPCR解析など) の基本サービスであり、当社の受託解析サービス以外での解析における必要なDNA量および品質を保証するものではありません。
・ 当社において、ショットガンメタゲノム解析での最適なDNA抽出方法の検証は行っておりません。
・ DNAの収量は、検体の採取量および保存状態に依存します。あらかじめご了承下さい。
・ DNAの断片化や収量の評価については、オプションサービスをご依頼下さい。
・ DNA抽出物は液量70 µL以上を納品します。
・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
ご依頼は、以下のファイルよりお申し込み下さい。
確認と同意事項
分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通） およびテクノスルガ・ラボ基本約款 を確認しました。
